RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 CD300LBA8K4G0 201 aa17.11■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 GUCA2AQ02747 115 aa17.11■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 VTCN1Q7Z7D3 282 aa17.11■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 NAA40Q86UY6 237 aa17.11■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 OR5R1Q8NH85 324 aa17.11■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 TSSK2Q96PF2 358 aa17.11■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 ATF6BQ99941 703 aa17.11■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 PPA2Q9H2U2 334 aa17.11■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 SIGLEC7Q9Y286 467 aa17.11■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa17.11■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 A6NLC8 198 aa17.1■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 NME4O00746 187 aa17.1■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 PTP4A3O75365 173 aa17.1■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 PAHP00439 452 aa17.1■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 SLC7A2P52569 658 aa17.1■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 LOXL3P58215 753 aa17.1■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 POU4F2Q12837 409 aa17.1■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 CFAP77Q6ZQR2 320 aa17.1■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 ZNF826PQ6ZT77 177 aa17.1■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 CMTM4Q8IZR5 234 aa17.1■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 GCSAMQ8N6F7 178 aa17.1■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 SPAG4Q9NPE6 437 aa17.1■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa17.09■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa17.09■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 DCTN6O00399 190 aa17.09■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 PPP1R3DO95685 299 aa17.09■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 GRPP07492 148 aa17.09■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 GGT2P36268 569 aa17.09■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 RPS6KA3P51812 740 aa17.09■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 TPTEP56180 551 aa17.09■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 SLC18B1Q6NT16 456 aa17.09■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 LINC00346Q8IVM7 164 aa17.09■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 SPERTQ8NA61 448 aa17.09■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa17.09■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 SIRT7Q9NRC8 400 aa17.09■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
NELFE-210ENST00000491139 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa17.08■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa17.08■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 GGT3PA6NGU5 568 aa17.08■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 NPFFO15130 113 aa17.08■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 TXNDC12O95881 172 aa17.08■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 LIPEQ05469 1076 aa17.08■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 TEX36Q5VZQ5 186 aa17.08■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 C11orf88Q6PI97 169 aa17.08■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa17.08■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 C11orf44Q8N8P7 122 aa17.08■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 LY6G5BQ8NDX9 201 aa17.08■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 SLC26A10Q8NG04 563 aa17.08■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 DMRTB1Q96MA1 342 aa17.08■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 B9D1Q9UPM9 204 aa17.08■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 SIGLEC9Q9Y336 463 aa17.08■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 A0A1W2PRD5 423 aa17.07■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 A0A1W2PRF3 423 aa17.07■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 A0A1W2PRM7 423 aa17.07■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 LHBP01229 141 aa17.07■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 GSK3BP49841 420 aa17.07■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 PSME3P61289 254 aa17.07■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 MZT1Q08AG7 82 aa17.07■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 KRT72Q14CN4 511 aa17.07■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 MICBQ29980 383 aa17.07■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 SLC36A3Q495N2 470 aa17.07■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa17.07■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 OR6V1Q8N148 313 aa17.07■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 FGFRL1Q8N441 504 aa17.07■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 SLC7A13Q8TCU3 470 aa17.07■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 CFHR4Q92496 578 aa17.07■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 ANKRD19PQ9H560 264 aa17.07■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP17.07■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 C14orf119Q9NWQ9 140 aa17.07■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 NDE1Q9NXR1 346 aa17.07■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 DNAJB11Q9UBS4 358 aa17.07■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 TAGLN3Q9UI15 199 aa17.07■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 M0R135 149 aa17.06■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 ZNF682O95780 498 aa17.06■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 EFNB2P52799 333 aa17.06■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 ZNF92Q03936 586 aa17.06■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 SPATS1Q496A3 300 aa17.06■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 IFI44LQ53G44 452 aa17.06■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 FKBP9P1Q75LS8 142 aa17.06■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 PGAM4Q8N0Y7 254 aa17.06■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 SGCDQ92629 289 aa17.06■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 ZNF799Q96GE5 643 aa17.06■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 CCL13Q99616 98 aa17.06■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa17.06■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 FOXJ3Q9UPW0 622 aa17.06■□□□□ 0.32
NELFE-210ENST00000491139 A0A1B0GW55 424 aa17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms