RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF878C9JN71 531 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 PITPNBP48739 271 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 OR8B3Q8NGG8 313 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 OR56B2PQ8NGI1 322 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 OR6K6Q8NGW6 343 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 OR8B2Q96RD0 313 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 AMELYQ99218 206 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 CHID1Q9BWS9 393 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 CENPMQ9NSP4 180 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 CTSZQ9UBR2 303 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 ARRDC5A6NEK1 342 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 PLATP00750 562 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 GK3PQ14409 553 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 LRRN1Q6UXK5 716 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 C9orf139Q6ZV77 190 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 PLPP7Q8NBV4 271 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 OR11L1Q8NGX0 322 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 PLEKHA8Q96JA3 519 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 RNF7Q9UBF6 113 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 GGT3PA6NGU5 568 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 C22orf46C9J442 243 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 FCN3O75636 299 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 IFNGP01579 166 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 IRF2P14316 349 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 GRK5P34947 590 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 SPATC1Q76KD6 591 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 DPY19L4Q7Z388 723 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 PARP8Q8N3A8 854 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 GIPC3Q8TF64 312 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 CANT1Q8WVQ1 401 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 RNF133Q8WVZ7 376 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 ABHD6Q9BV23 337 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 FN3KRPQ9HA64 309 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 RIIAD1A6NNX1 92 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 PHYHO14832 338 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF3P17036 446 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 PRTN3P24158 256 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 BLVRAP53004 296 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 KLHL12Q53G59 568 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 AWAT1Q58HT5 328 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 NLRC3Q7RTR2 1065 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 TIGD4Q8IY51 512 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 OPA3Q9H6K4 179 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF319Q9P2F9 582 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 CLN8Q9UBY8 286 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 XRCC2O43543 280 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 CST1P01037 141 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 CX3CR1P49238 355 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 GRB2P62993 217 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 FAM3AP98173 230 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 BTNL3Q6UXE8 466 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF826PQ6ZT77 177 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 SLC16A9Q7RTY1 509 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 WDR86Q86TI4 376 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 TEX47Q8TBZ9 253 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 SGK3Q96BR1 496 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 DUX5Q96PT3 197 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 INTS14Q96SY0 518 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 LGALS8O00214 317 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 GLCEO94923 617 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 OPRL1P41146 370 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 TAF13Q15543 124 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 C11orf53Q8IXP5 236 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 GCSAMQ8N6F7 178 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 OR6N2Q8NGY6 317 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 THTPAQ9BU02 230 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 AQP12BA6NM10 295 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 LHBP01229 141 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 HKR1P10072 659 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 GSTT1P30711 240 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 RHOUQ7L0Q8 258 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 AQP12AQ8IXF9 295 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 HS3ST5Q8IZT8 346 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 C3orf56Q8N813 242 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 LRGUKQ96M69 825 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 TOR3AQ9H497 397 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 SMURF1Q9HCE7 757 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 C1orf123Q9NWV4 160 aa23.11■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 TRAV40A0A0B4J280 105 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 C3orf80F5H4A9 247 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 H3BN98 237 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 EGR1P18146 543 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 DDOSTP39656 456 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 SLC15A1P46059 708 aa23.1■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 SPERTQ8NA61 448 aa23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 741.2 ms