RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 OR4K5Q8NGD3 323 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 ADAM19Q9H013 955 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 ADAP2Q9NPF8 381 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 CACFD1Q9UGQ2 172 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 A4GNTQ9UNA3 340 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 A0A1W2PPH5 198 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 OR5H14A6NHG9 310 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 FAM183AA6NL82 134 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 C22orf46C9J442 243 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 ALOX12BO75342 701 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 NGFRP08138 427 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 MAS1LP35410 378 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 CAV2P51636 162 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 RAB35Q15286 201 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 DEFB110Q30KQ9 67 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 SHISA5Q8N114 240 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 BEST3Q8N1M1 668 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 OR2L13Q8N349 312 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 RNF175Q8N4F7 328 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 OR9A4Q8NGU2 314 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 OR5R1Q8NH85 324 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 LGALS14Q8TCE9 139 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 ADIPOR1Q96A54 375 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 UBQLN3Q9H347 655 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 EGLN3Q9H6Z9 239 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 RHOFQ9HBH0 211 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 NCKAP5O14513 1909 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 F8VVB4 439 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 F8VWA3 439 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 SURF4O15260 269 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 HSPA12AO43301 675 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 B3GALT2O43825 422 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 IFNA17P01571 189 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 OPN1LWP04000 364 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 SERPINA7P05543 415 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 THBS1P07996 1170 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 CASRP41180 1078 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 FOLR3P41439 243 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 PTH2RP49190 550 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 VWA2Q5GFL6 755 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 ARL9Q6T311 187 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 DRAM2Q6UX65 266 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 DNM1P46Q6ZS02 220 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 SIRT6Q8N6T7 355 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 SLC30A7Q8NEW0 376 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 OR10AD1Q8NGE0 317 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 OR4D11Q8NGI4 311 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 FAM96BQ9Y3D0 163 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 PIEZO1Q92508 2521 aa6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 ZNF726A6NNF4 738 aa6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 K7EP13 123 aa6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 MFNGO00587 321 aa6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 ZFPL1O95159 310 aa6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 AIFM1O95831 613 aa6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 PPBPP02775 128 aa6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 CD5P06127 495 aa6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 IL3P08700 152 aa6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 IL2RGP31785 369 aa6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 P2RX1P51575 399 aa6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 ACSM2AQ08AH3 577 aa6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 ACSM3Q53FZ2 586 aa6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 ZNF385BQ569K4 471 aa6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 ACSM2BQ68CK6 577 aa6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 ACBD7Q8N6N7 88 aa6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 C10orf53Q8N6V4 93 aa6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 OR5AP2Q8NGF4 316 aa6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 OR6N1Q8NGY5 312 aa6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 SFXN5Q8TD22 340 aa6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 C16orf78Q8WTQ4 265 aa6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 CCDC107Q8WV48 283 aa6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 TNFRSF14Q92956 283 aa6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 ISOC2Q96AB3 205 aa6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 PPCDCQ96CD2 204 aa6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 C1orf198Q9H425 327 aa6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 USP24Q9UPU5 2620 aa6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 A0A1B0GTI1 187 aa6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 A0A1W2PPQ1 181 aa6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 F5H0A9 414 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 ACOT7O00154 380 aa6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 FAM157CP0CG43 387 aa6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 ZNF763Q0D2J5 394 aa6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 HNF4GQ14541 408 aa6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms