RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 DEGS2Q6QHC5 323 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 GLCCI1Q86VQ1 547 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 OR56B2PQ8NGI1 322 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 ASB17Q8WXJ9 295 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 SPSB4Q96A44 273 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 LPAR2Q9HBW0 351 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 UBAP1Q9NZ09 502 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 SONP18583 2426 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 NAV3Q8IVL0 2385 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 ZFHX3Q15911 3703 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 LRRC30A6NM36 301 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 ALPLP05186 524 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 IRF2P14316 349 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 ANOS1P23352 680 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 ALDH3A2P51648 485 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 MZT1Q08AG7 82 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 PRSS45Q7RTY3 260 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 MOGAT3Q86VF5 341 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 C1orf87Q8N0U7 546 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 SPERTQ8NA61 448 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 OR8J1Q8NGP2 316 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 OR51F2Q8NH61 342 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 STMN2Q93045 179 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 ERGIC1Q969X5 290 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 MNTQ99583 582 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 C9orf16Q9BUW7 83 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 RGCCQ9H4X1 137 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 IMPAD1Q9NX62 359 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 DCAF16Q9NXF7 216 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 USE1Q9NZ43 259 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 IKZF2Q9UKS7 526 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 LRP12Q9Y561 859 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-209ENST00000484097 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP16.27■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A1B0GWJ7 208 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM178BH3BS89 294 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 PSMD9O00233 223 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 PHYHO14832 338 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF254O75437 659 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 BAG2O95816 211 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 MSMBP08118 114 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 CD200P41217 278 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM3AP98173 230 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 SNCBQ16143 134 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 CR1LQ2VPA4 569 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM120AOSQ5T036 256 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC35F2Q8IXU6 374 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 KLHL36Q8N4N3 616 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 CBR4Q8N4T8 237 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 SPICQ8N5J4 248 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 OR11L1Q8NGX0 322 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 HAO2Q9NYQ3 351 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 IFNA2P01563 188 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 IGHV2-70P01814 119 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 IGHV2-5P01817 119 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 ATP6V1E1P36543 226 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 MMP16P51512 607 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 RIDAP52758 137 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 BTG1P62324 171 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 MAB21L1Q13394 359 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 KLBQ86Z14 1044 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF679Q8IYX0 411 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 PQLC1Q8N2U9 271 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 OR51G2Q8NGK0 314 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 OR8S1Q8NH09 359 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM81AQ8TBF8 368 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM186Q96B77 213 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 OR8B4Q96RC9 309 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF319Q9P2F9 582 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 COPS3Q9UNS2 423 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 ACOD1A6NK06 481 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 HTR1FP30939 366 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 GATA4P43694 442 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 GSK3AP49840 483 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 CXCR4P61073 352 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 POU4F2Q12837 409 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF181Q2M3W8 571 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM155Q4W5P6 130 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-209ENST00000484097 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms