RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483778.5

ATG4B-221, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 3

Gene ATG4B, Length 1,103 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-221ENST00000483778 CENPMQ9NSP4 180 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 C1orf123Q9NWV4 160 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 KCNG2Q9UJ96 466 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 LGALS8O00214 317 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 PHYHO14832 338 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 GMDSO60547 372 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 KRT36O76013 467 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 SOX14O95416 240 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 GYPAP02724 150 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 SPARCP09486 303 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 PCK2Q16822 640 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 C16orf87Q6PH81 154 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 DRAM2Q6UX65 266 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 OR56B2PQ8NGI1 322 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 SLAMF6Q96DU3 332 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 TBX15Q96SF7 602 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 PCGF1Q9BSM1 259 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 ZNF696Q9H7X3 374 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 MED20Q9H944 212 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 FN3KRPQ9HA64 309 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 ARMC1Q9NVT9 282 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 VWFP04275 2813 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 A0A1B0GW55 424 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 ADAM20O43506 726 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 DUX4L2P0CJ85 424 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 DUX4L3P0CJ86 424 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 DUX4L4P0CJ87 422 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 DUX4L5P0CJ88 424 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 DUX4L6P0CJ89 424 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 DUX4L7P0CJ90 424 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 MMP9P14780 707 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 SPI1P17947 270 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 CFHR2P36980 270 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 MS4A2Q01362 244 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 WDR86Q86TI4 376 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 GCSAMQ8N6F7 178 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 AQP11Q8NBQ7 271 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 OR52L1Q8NGH7 329 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 TMIGD2Q96BF3 282 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 SEH1LQ96EE3 360 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 TECTBQ96PL2 329 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 KCNJ15Q99712 375 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 COPS4Q9BT78 406 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 TRIM15Q9C019 465 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 MARCH7Q9H992 704 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 ZNF319Q9P2F9 582 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 DUX4Q9UBX2 424 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 U3KQV3 271 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 FAM181BA6NEQ2 426 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 CCNB2O95067 398 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 LHBP01229 141 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 FMO3P31513 532 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 MAGEA2P43356 314 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 ENTPD1P49961 510 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 IL13RA1P78552 427 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 OR8B8Q15620 311 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 LINC01590Q5TEZ4 76 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 FAM90A1Q86YD7 464 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 SGK3Q96BR1 496 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 AMELYQ99218 206 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 TBC1D23Q9NUY8 699 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 ACTR3BQ9P1U1 418 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 DHRS12A0PJE2 317 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 FAM183AA6NL82 134 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 ENSAO43768 121 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 SLC25A1P53007 311 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 GNGT1P63211 74 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 MXRA7P84157 204 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 FAM3AP98173 230 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 RELBQ01201 579 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 TAF13Q15543 124 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 KLHL12Q53G59 568 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 TEX30Q5JUR7 227 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 C16orf89Q6UX73 402 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 Q6YL49 198 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 PRSS45Q7RTY3 260 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 ZDHHC16Q969W1 377 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 SPSB4Q96A44 273 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 SLC22A4Q9H015 551 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 ERVK-18Q9QC07 812 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 TGP01266 2768 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 OOEPA6NGQ2 149 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 A6NLC8 198 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 POM121CA8CG34 1229 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 B2RBV5 119 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 SRRM5B3KS81 715 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 ZNF879B4DU55 563 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 TOX4O94842 621 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 MICAQ29983 383 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 GPR157Q5UAW9 335 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-221ENST00000483778 SLC16A9Q7RTY1 509 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms