RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479054.5

NISCH-207, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-207ENST00000479054 CDK5R1Q15078 307 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 BHLHE23Q8NDY6 225 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 ADAM10O14672 748 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 FTH1P19P0C7X4 201 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 NFYBP25208 207 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 PPT1P50897 306 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 HMGN3Q15651 99 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 GSG1Q2KHT4 349 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 SMIM21Q3B7S5 101 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 C9orf152Q5JTZ5 239 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 SYT9Q86SS6 491 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 DDOQ99489 341 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 C12orf10Q9HB07 376 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 A0A096LPE4 126 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 A0A1W2PPZ6 126 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 FCARP24071 287 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 OPRM1P35372 400 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 RPS27P42677 84 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 NDUFA6P56556 154 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 CLDN6P56747 220 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 C20orf85Q9H1P6 137 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 AMDHD2Q9Y303 409 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 FFAR1O14842 300 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 ZNF728P0DKX0 622 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 PLXDC2Q6UX71 529 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 FBXW12Q6X9E4 464 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 FAM185AQ8N0U4 392 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 OR10Z1Q8NGY1 313 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 APH1BQ8WW43 257 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 SCPEP1Q9HB40 452 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 MYOFQ9NZM1 2061 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 TRABD2BA6NFA1 517 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 ALG1L2C9J202 215 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 C17orf112F2Z3M2 114 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 CT45A6P0DMU7 189 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 CT45A5P0DMU8 189 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 CT45A7P0DMV0 189 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 CT45A8P0DMV1 189 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 CT45A9P0DMV2 189 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 KITLGP21583 273 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 CEACAM16Q2WEN9 425 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 CT45A2Q5DJT8 189 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 CT45A1Q5HYN5 189 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 LYPD8Q6UX82 237 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 OR5D18Q8NGL1 313 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 CT45A3Q8NHU0 189 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 PIGMQ9H3S5 423 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 OCIAD1Q9NX40 245 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 LIPCP11150 499 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 THBS3P49746 956 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 H3F3CQ6NXT2 135 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 TFAP2EQ6VUC0 442 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 ZNF679Q8IYX0 411 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 C14orf79Q96F83 325 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 C1orf123Q9NWV4 160 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 A0A1W2PPV4 95 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 BHLHE40O14503 412 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 NRASP01111 189 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 PCMT1P22061 227 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 ZNF74Q16587 644 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 CORO6Q6QEF8 472 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 TEX261Q6UWH6 196 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 OR1M1Q8NGA1 313 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 OR13C5Q8NGS8 318 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 CORO2AQ92828 525 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 MALSU1Q96EH3 234 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 S1PR3Q99500 378 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 DDA1Q9BW61 102 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 CACFD1Q9UGQ2 172 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 SLC5A6Q9Y289 635 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 U3KQ87 197 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 A0A0A6YYJ9 748 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 CNIH1O95406 144 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 ADH4P08319 380 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 DOK1Q99704 481 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 SSUH2Q9Y2M2 353 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 ZNF236Q9UL36 1845 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 LGALS8O00214 317 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 GPR155Q7Z3F1 870 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 OR10G3Q8NGC4 313 aa12.24□□□□□ -0.45
NISCH-207ENST00000479054 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms