RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-208ENST00000476423 B9D2Q9BPU9 175 aa6.68□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 KATNB1Q9BVA0 655 aa6.68□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 SLC38A1Q9H2H9 487 aa6.68□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 SMURF2Q9HAU4 748 aa6.68□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 RLIMQ9NVW2 624 aa6.68□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 RDH8Q9NYR8 311 aa6.68□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF69Q9UC07 566 aa6.68□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.68□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa6.68□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 ALG5Q9Y673 324 aa6.68□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 U3KQK5 164 aa6.68□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 RYR2Q92736 4967 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 A0A1W2PPL8 197 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 ELOVL7A1L3X0 281 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 FABP12A6NFH5 140 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 FAM220BPB1ANY3 271 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 NCR1O76036 304 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 AK1P00568 194 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 GKN3PP0CG01 181 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 IFI30P13284 250 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF250P15622 560 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 ARSBP15848 533 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 PRPS1L1P21108 318 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 S100PP25815 95 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 SDC2P34741 201 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 RPL3P39023 403 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 KRTAP10-3P60369 221 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 SLC35A1P78382 337 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 KCNJ10P78508 379 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 PIGFQ07326 219 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 FGL1Q08830 312 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 NPRL3Q12980 569 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 BTN1A1Q13410 526 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF79Q15937 498 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 SPANXN4Q5MJ08 99 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 ELFN2Q5R3F8 820 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 COX20Q5RI15 118 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 PHYHD1Q5SRE7 291 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 HES5Q5TA89 166 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 METTL11BQ5VVY1 283 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 MEDAGQ5VYS4 303 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 TRIQKQ629K1 86 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 FAHD1Q6P587 224 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 PAQR6Q6TCH4 344 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF836Q6ZNA1 936 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 KDM8Q8N371 416 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 ATG16L2Q8NAA4 619 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 CNIH3Q8TBE1 160 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 XAGE5Q8WWM1 108 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 RDH5Q92781 318 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 PYURFQ96I23 114 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 TEX37Q96LM6 180 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 TBX15Q96SF7 602 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 EPYCQ99645 322 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 SOSTQ9BQB4 213 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF251Q9BRH9 671 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 SLC35A5Q9BS91 424 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 PDCD10Q9BUL8 212 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 TAPBPLQ9BX59 468 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 MED28Q9H204 178 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 MS4A5Q9H3V2 200 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF665Q9H7R5 613 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 DYNLRB1Q9NP97 96 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 SLC6A13Q9NSD5 602 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 COA4Q9NYJ1 87 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 C1RLQ9NZP8 487 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 CHST2Q9Y4C5 530 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 U3KQV3 271 aa6.67□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 PPIAL4EA0A075B759 164 aa6.66□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa6.66□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 TMEM229AB2RXF0 380 aa6.66□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 FTCDNL1E5RQL4 147 aa6.66□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 ZNF587BE7ETH6 402 aa6.66□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 PPIAL4DF5H284 164 aa6.66□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 AIPO00170 330 aa6.66□□□□□ -1.34
SZRD1-208ENST00000476423 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms