RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476342.1

HOXB3-208, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,420 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-208ENST00000476342 SNX5Q9Y5X3 404 aa25.19■■□□□ 1.62
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HOXB3-208ENST00000476342 RPP14O95059 124 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
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HOXB3-208ENST00000476342 CSF3P09919 207 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXB3-208ENST00000476342 DCKP27707 260 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXB3-208ENST00000476342 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
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HOXB3-208ENST00000476342 TP53I3Q53FA7 332 aa25.18■■□□□ 1.62
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HOXB3-208ENST00000476342 OR13G1Q8NGZ3 307 aa25.18■■□□□ 1.62
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HOXB3-208ENST00000476342 TNFSF4P23510 183 aa25.17■■□□□ 1.62
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HOXB3-208ENST00000476342 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
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HOXB3-208ENST00000476342 C6orf141Q5SZD1 244 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXB3-208ENST00000476342 CATSPERDQ86XM0 798 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXB3-208ENST00000476342 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXB3-208ENST00000476342 ZNF786Q8N393 782 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXB3-208ENST00000476342 OR51E1Q8TCB6 317 aa25.12■■□□□ 1.61
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