RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	UBE2F	Q969M7	185 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	SGK3	Q96BR1	496 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	REEP6	Q96HR9	211 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	GAL3ST1	Q99999	423 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	TOR3A	Q9H497	397 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	S100A14	Q9HCY8	104 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM160	Q9NX00	188 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	USE1	Q9NZ43	259 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	AASS	Q9UDR5	926 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	NPTN	Q9Y639	398 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	GGT3P	A6NGU5	568 aa		9.35	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	MSMB	P08118	114 aa		9.35	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	TNFRSF1A	P19438	455 aa		9.35	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	TNFSF4	P23510	183 aa		9.35	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	ACKR3	P25106	362 aa		9.35	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	CD200	P41217	278 aa		9.35	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC15A1	P46059	708 aa		9.35	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	TIGD6	Q17RP2	521 aa		9.35	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		9.35	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		9.35	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		9.35	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR8B4	Q96RC9	309 aa		9.35	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC29A1	Q99808	456 aa		9.35	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	TEX12	Q9BXU0	123 aa		9.35	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		9.35	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		9.35	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		9.35	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM206A	Q9NX38	181 aa		9.35	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		9.35	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		9.34	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		9.34	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		9.34	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	C3orf80	F5H4A9	247 aa		9.34	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM178B	H3BS89	294 aa		9.34	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM20B	O75063	409 aa		9.34	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	9.34	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	GATA4	P43694	442 aa		9.34	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	9.34	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	ALDH3A2	P51648	485 aa		9.34	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	9.34	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	CXCR4	P61073	352 aa		9.34	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	BTG1	P62324	171 aa		9.34	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR8G1	Q15617	311 aa		9.34	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		9.34	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		9.34	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRT77	Q7Z794	578 aa		9.34	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		9.34	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		9.34	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	RAB1C	Q92928	201 aa		9.34	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		9.34	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	TIMD4	Q96H15	378 aa		9.34	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	PGAM5	Q96HS1	289 aa		9.34	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	TBX5	Q99593	518 aa		9.34	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM100	Q9NV29	134 aa		9.34	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		9.34	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	JMJD1C	Q15652	2540 aa		9.34	□□□□□ -0.91
GTPBP1-208	ENST00000475959		B4DSR2	109 aa		9.33	□□□□□ -0.92
GTPBP1-208	ENST00000475959		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	9.33	□□□□□ -0.92
GTPBP1-208	ENST00000475959	PLPP2	O43688	288 aa		9.33	□□□□□ -0.92
GTPBP1-208	ENST00000475959	PNP	P00491	289 aa		9.33	□□□□□ -0.92
GTPBP1-208	ENST00000475959	AVP	P01185	164 aa		9.33	□□□□□ -0.92
GTPBP1-208	ENST00000475959	SBK2	P0C263	348 aa		9.33	□□□□□ -0.92
GTPBP1-208	ENST00000475959	EGR1	P18146	543 aa		9.33	□□□□□ -0.92
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	9.33	□□□□□ -0.92
GTPBP1-208	ENST00000475959	CD80	P33681	288 aa		9.33	□□□□□ -0.92
GTPBP1-208	ENST00000475959	GSK3A	P49840	483 aa		9.33	□□□□□ -0.92
GTPBP1-208	ENST00000475959	CSNK2B	P67870	215 aa		9.33	□□□□□ -0.92
GTPBP1-208	ENST00000475959	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	9.33	□□□□□ -0.92
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC3A1	Q07837	685 aa		9.33	□□□□□ -0.92
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR8B8	Q15620	311 aa		9.33	□□□□□ -0.92
GTPBP1-208	ENST00000475959	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	9.33	□□□□□ -0.92
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		9.33	□□□□□ -0.92
GTPBP1-208	ENST00000475959	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		9.33	□□□□□ -0.92
GTPBP1-208	ENST00000475959	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		9.33	□□□□□ -0.92
GTPBP1-208	ENST00000475959	GID4	Q8IVV7	300 aa		9.33	□□□□□ -0.92
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR51F2	Q8NH61	342 aa		9.33	□□□□□ -0.92
GTPBP1-208	ENST00000475959		Q8TCH9	128 aa		9.33	□□□□□ -0.92
GTPBP1-208	ENST00000475959	EME1	Q96AY2	570 aa		9.33	□□□□□ -0.92
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM186	Q96B77	213 aa		9.33	□□□□□ -0.92
GTPBP1-208	ENST00000475959	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		9.33	□□□□□ -0.92
GTPBP1-208	ENST00000475959	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	9.33	□□□□□ -0.92
GTPBP1-208	ENST00000475959	APOL4	Q9BPW4	351 aa		9.33	□□□□□ -0.92
GTPBP1-208	ENST00000475959	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		9.33	□□□□□ -0.92
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR10A2	Q9H208	303 aa		9.33	□□□□□ -0.92
GTPBP1-208	ENST00000475959	OPA3	Q9H6K4	179 aa		9.33	□□□□□ -0.92
GTPBP1-208	ENST00000475959	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		9.33	□□□□□ -0.92
GTPBP1-208	ENST00000475959	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		9.33	□□□□□ -0.92
GTPBP1-208	ENST00000475959	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	9.33	□□□□□ -0.92
GTPBP1-208	ENST00000475959	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	9.33	□□□□□ -0.92
GTPBP1-208	ENST00000475959	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		9.33	□□□□□ -0.92

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