RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 WIPI2Q9Y4P8 454 aa16.02■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 LRP12Q9Y561 859 aa16.02■□□□□ 0.16
SYF2-203ENST00000474160 FN1P02751 2386 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 LRP5LA4QPB2 252 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 INAFM1C9JVW0 142 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 MLNRO43193 412 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 TBX1O43435 398 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 SBK2P0C263 348 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 SLC2A1P11166 492 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 CDH15P55291 814 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 EGR3Q06889 387 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 LRRN1Q6UXK5 716 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 FAM57BQ71RH2 274 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 C1orf87Q8N0U7 546 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 FAM81AQ8TBF8 368 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 EME1Q96AY2 570 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 SGK3Q96BR1 496 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 REEP6Q96HR9 211 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 OR8B4Q96RC9 309 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 ADGRL4Q9HBW9 690 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 GCM1Q9NP62 436 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 ABCB9Q9NP78 766 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 NPTNQ9Y639 398 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 NF1P21359 2839 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 LRRC30A6NM36 301 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 MPZL2O60487 215 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 LMX1BO60663 402 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 CRLF1O75462 422 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 OR2T7P0C7T2 308 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 RIDAP52758 137 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 FAM3AP98173 230 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 OR8G1Q15617 311 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 TMEM155Q4W5P6 130 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 SLC35F2Q8IXU6 374 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 OR10AD1Q8NGE0 317 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 OR56B2PQ8NGI1 322 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 OR2T27Q8NH04 317 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 MOB1AQ9H8S9 216 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 CACNG2Q9Y698 323 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 A0A0U1RQV5 110 aa15.99■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 M0R129 80 aa15.99■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 BAG2O95816 211 aa15.99■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 ATP6V1B1P15313 513 aa15.99■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 MMP16P51512 607 aa15.99■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 OR8B8Q15620 311 aa15.99■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 OCLNQ16625 522 aa15.99■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 SPICQ8N5J4 248 aa15.99■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 Q8TCH9 128 aa15.99■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 POM121Q96HA1 1249 aa15.99■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa15.99■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa15.98■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 TGFAP01135 160 aa15.98■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 IGHV2-70P01814 119 aa15.98■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 LMO4P61968 165 aa15.98■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 MVKQ03426 396 aa15.98■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 OR51G2Q8NGK0 314 aa15.98■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 ZNF665Q9H7R5 613 aa15.98■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 C14orf119Q9NWQ9 140 aa15.98■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 COPS3Q9UNS2 423 aa15.98■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 GMPPBQ9Y5P6 360 aa15.98■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 NAV3Q8IVL0 2385 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 F5H5P2 479 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 H0YL77 283 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 TMEM178BH3BS89 294 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 IGHV2-5P01817 119 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 IRF2P14316 349 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 CA6P23280 308 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 IL2RGP31785 369 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 ATP6V1E1P36543 226 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 GSK3AP49840 483 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 HCCSP53701 268 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 CXCR4P61073 352 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 BTG1P62324 171 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 MAB21L1Q13394 359 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 SPRNQ5BIV9 151 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 KRT74Q7RTS7 529 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-203ENST00000474160 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.2 ms