RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		15.05	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		15.04	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		15.04	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		15.04	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		15.04	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902		F5H5P2	479 aa		15.04	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	ENTPD6	O75354	484 aa		15.04	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	CA6	P23280	308 aa		15.04	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	15.04	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	15.04	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	OR8G1	Q15617	311 aa		15.04	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		15.04	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		15.04	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		15.04	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		15.04	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	TIMD4	Q96H15	378 aa		15.04	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	APOL4	Q9BPW4	351 aa		15.04	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		15.04	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		15.04	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	AASS	Q9UDR5	926 aa		15.04	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	15.04	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		15.04	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	SNTN	A6NMZ2	147 aa		15.03	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	15.03	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	MLNR	O43193	412 aa		15.03	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	ZNF254	O75437	659 aa		15.03	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	15.03	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	PEX2	P28328	305 aa		15.03	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	15.03	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	ROM1	Q03395	351 aa		15.03	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	SLC3A1	Q07837	685 aa		15.03	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	TMED1	Q13445	227 aa		15.03	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		15.03	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		15.03	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		15.03	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	15.03	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	COMMD2	Q86X83	199 aa		15.03	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	RAB1C	Q92928	201 aa		15.03	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		15.03	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	15.03	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	15.03	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	15.02	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	ISPD	A4D126	451 aa		15.02	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		15.02	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	PRR32	B1ATL7	298 aa		15.02	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	CD5L	O43866	347 aa		15.02	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	TACSTD2	P09758	323 aa		15.02	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	OR2T7	P0C7T2	308 aa		15.02	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		15.02	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	DDOST	P39656	456 aa		15.02	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	MTNR1A	P48039	350 aa		15.02	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	GZMK	P49863	264 aa		15.02	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	15.02	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	FAM3A	P98173	230 aa		15.02	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		15.02	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	15.02	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	OCLN	Q16625	522 aa		15.02	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	15.02	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		15.02	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	OR2T27	Q8NH04	317 aa		15.02	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	CYGB	Q8WWM9	190 aa		15.02	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	SPSB4	Q96A44	273 aa		15.02	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	RNFT2	Q96EX2	444 aa		15.02	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		15.02	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	RDH12	Q96NR8	316 aa		15.02	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	15.02	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902	SLC22A4	Q9H015	551 aa		15.02	■□□□□ -0
USP19-210	ENST00000465902		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	WNT9B	O14905	357 aa		15.01	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	MPZL2	O60487	215 aa		15.01	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	KRT8	P05787	483 aa		15.01	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	IL2RG	P31785	369 aa		15.01	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	GSK3A	P49840	483 aa		15.01	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	EGR3	Q06889	387 aa		15.01	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		15.01	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	SSX6	Q7RTT6	188 aa		15.01	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		15.01	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		15.01	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		15.01	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902		Q96MT0	163 aa		15.01	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	RGCC	Q9H4X1	137 aa		15.01	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		15.01	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	C8orf4	Q9NR00	106 aa		15.01	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		15.01	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		15.01	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		15.01	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	JMJD1C	Q15652	2540 aa		15	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		15	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		15	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902		E9PQ18	207 aa		15	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		15	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	SLC16A6	O15403	523 aa		15	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	GMDS	O60547	372 aa		15	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01

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