RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 SIGLEC6O43699 453 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 CBR3O75828 277 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 DKK1O94907 266 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 KDM4BO94953 1096 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 MPZL1O95297 269 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 VSIG8P0DPA2 414 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ZNF35P13682 527 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 PRF1P14222 555 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ZP3P21754 424 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ZBTB25P24278 435 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ZNF84P51523 738 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 P2RY4P51582 365 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 H2BFSP57053 126 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 TAS2R46P59540 309 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 CCL7P80098 99 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 H3F3AP84243 136 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 GUCA2AQ02747 115 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 DHRS2Q13268 280 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 TMEM128Q5BJH2 165 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 C11orf87Q6NUJ2 197 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ARSKQ6UWY0 536 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 DBX2Q6ZNG2 339 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 FJX1Q86VR8 437 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ANGPTL5Q86XS5 388 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 STPG2Q8N412 459 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 FAM89BQ8N5H3 189 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 CHST4Q8NCG5 386 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 AGBL5Q8NDL9 886 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 OR4D6Q8NGJ1 314 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 OR1J2Q8NGS2 313 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 OR8S1Q8NH09 359 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 TERB2Q8NHR7 220 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 THAP6Q8TBB0 222 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 POC1BQ8TC44 478 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 RHBDD1Q8TEB9 315 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 KCNE4Q8WWG9 221 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 NTNG2Q96CW9 530 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 SGCZQ96LD1 299 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 RASL10BQ96S79 203 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 FAM117AQ9C073 453 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 NELFAQ9H3P2 528 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 CDCP1Q9H5V8 836 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 SEC61A2Q9H9S3 476 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 MED29Q9NX70 200 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 FBXL2Q9UKC9 423 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 SEC16AO15027 2179 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 RP1P56715 2156 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 KIF26BQ2KJY2 2108 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 EXPH5Q8NEV8 1989 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 A0A087WV48 116 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 C9orf170A2RU37 121 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 FIGNL2A6NMB9 653 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 SERPINE3A8MV23 424 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 H3BML4 177 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 TEX46H3BTG2 121 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 LINC01387J3KSC0 135 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 CDK2AP1O14519 115 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 EFNA2O43921 213 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 OR2J2O76002 312 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 STK17BO94768 372 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 QDPRP09417 244 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 PTHLHP12272 177 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 CD59P13987 128 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 MSR1P21757 451 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ACP1P24666 158 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 MPGP29372 298 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 PLA2G5P39877 138 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 CASRP41180 1078 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 CSNK1A1P48729 337 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 HIST1H3AP68431 136 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 IL13RA1P78552 427 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 NAAAQ02083 359 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 FMODQ06828 376 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 PLA2G7Q13093 441 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 AWAT2Q6E213 333 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 FAAP20Q6NZ36 180 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 HIST2H3AQ71DI3 136 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 OVCH2Q7RTZ1 564 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 HOGA1Q86XE5 327 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 LINC00346Q8IVM7 164 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ZNF101Q8IZC7 436 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 KDM8Q8N371 416 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 BMPERQ8N8U9 685 aa7.53□□□□□ -1.2
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