RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 DNM1P46Q6ZS02 220 aa20.32■□□□□ 0.84
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FAAP20-209ENST00000428120 DOCK7Q96N67 2140 aa20.32■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 EXO5Q9H790 373 aa20.32■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 COPZ2Q9P299 210 aa20.32■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 MTFP1Q9UDX5 166 aa20.32■□□□□ 0.84
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FAAP20-209ENST00000428120 AWAT2Q6E213 333 aa20.31■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 SLC16A14Q7RTX9 510 aa20.31■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 FDCSPQ8NFU4 85 aa20.31■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 NPRL2Q8WTW4 380 aa20.31■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa20.31■□□□□ 0.84
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FAAP20-209ENST00000428120 SLC7A10Q9NS82 523 aa20.31■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 AKAP13Q12802 2813 aa20.31■□□□□ 0.84
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FAAP20-209ENST00000428120 H2AFB2P0C5Z0 115 aa20.31■□□□□ 0.84
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FAAP20-209ENST00000428120 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
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FAAP20-209ENST00000428120 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 OR2AE1Q8NHA4 323 aa20.31■□□□□ 0.84
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FAAP20-209ENST00000428120 C20orf85Q9H1P6 137 aa20.31■□□□□ 0.84
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FAAP20-209ENST00000428120 PGAP1Q75T13 922 aa20.3■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 BTN2A1Q7KYR7 527 aa20.3■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 FAM109AQ8N4B1 249 aa20.3■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 BEST4Q8NFU0 473 aa20.3■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 OR1F12Q8NHA8 337 aa20.3■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
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FAAP20-209ENST00000428120 UQCC2Q9BRT2 126 aa20.3■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa20.3■□□□□ 0.84
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FAAP20-209ENST00000428120 SCRN3Q0VDG4 424 aa20.3■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 OR4D10Q8NGI6 311 aa20.3■□□□□ 0.84
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FAAP20-209ENST00000428120 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 OLFML2AQ68BL7 652 aa20.28■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF101Q8IZC7 436 aa20.28■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 OR8S1Q8NH09 359 aa20.28■□□□□ 0.84
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FAAP20-209ENST00000428120 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
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FAAP20-209ENST00000428120 TMEM178AQ8NBL3 297 aa20.28■□□□□ 0.84
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FAAP20-209ENST00000428120 GPER1Q99527 375 aa20.28■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 OR2H1Q9GZK4 316 aa20.28■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 WNT5BQ9H1J7 359 aa20.28■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 GHITMQ9H3K2 345 aa20.28■□□□□ 0.84
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FAAP20-209ENST00000428120 SPRR3Q9UBC9 169 aa20.28■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa20.28■□□□□ 0.84
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FAAP20-209ENST00000428120 TMEM235A6NFC5 223 aa20.27■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 BPNT1O95861 308 aa20.27■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 APOC1P02654 83 aa20.27■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 GSG1Q2KHT4 349 aa20.27■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 LINC00303Q3SY05 128 aa20.27■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa20.27■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 OR5D18Q8NGL1 313 aa20.27■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 OR4C16Q8NGL9 310 aa20.27■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 OR10A2Q9H208 303 aa20.27■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 RAB22AQ9UL26 194 aa20.27■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 OR6C6A6NF89 314 aa20.27■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 NAP1L6A6NFF2 107 aa20.27■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 WIPF3A6NGB9 483 aa20.27■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 LCATP04180 440 aa20.27■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 GTF2F2P13984 249 aa20.27■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 VEGFCP49767 419 aa20.27■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 OR56B4Q8NH76 319 aa20.27■□□□□ 0.84
FAAP20-209ENST00000428120 PTX4Q96A99 478 aa20.27■□□□□ 0.84
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