RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428101.6

LMO1-202, Transcript of LIM domain only 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1-202ENST00000428101 IFNGP01579 166 aa22.7■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 RAP2AP10114 183 aa22.7■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 PSMB10P40306 273 aa22.7■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 TAF13Q15543 124 aa22.7■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 SPATC1Q76KD6 591 aa22.7■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 UPRTQ96BW1 309 aa22.7■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 DUX5Q96PT3 197 aa22.7■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 FN3KRPQ9HA64 309 aa22.7■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 RNF7Q9UBF6 113 aa22.7■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 CLN8Q9UBY8 286 aa22.7■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa22.7■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa22.69■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 RIIAD1A6NNX1 92 aa22.69■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 ACOT8O14734 319 aa22.69■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 PRTN3P24158 256 aa22.69■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 AWAT1Q58HT5 328 aa22.69■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 PARP8Q8N3A8 854 aa22.69■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 IQCF1Q8N6M8 205 aa22.69■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 PLPP7Q8NBV4 271 aa22.69■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 CCDC197Q8NCU1 140 aa22.69■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 OR56B2PQ8NGI1 322 aa22.69■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 SPSB4Q96A44 273 aa22.69■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 FEVQ99581 238 aa22.69■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 CHID1Q9BWS9 393 aa22.69■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 MED20Q9H944 212 aa22.69■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 TAS2R1Q9NYW7 299 aa22.69■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa22.68■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 FAM183AA6NL82 134 aa22.68■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 PHYHO14832 338 aa22.68■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 PLATP00750 562 aa22.68■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 ZNF3P17036 446 aa22.68■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 BLVRAP53004 296 aa22.68■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 ADGRG5Q8IZF4 528 aa22.68■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 GIPC3Q8TF64 312 aa22.68■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 XRCC2O43543 280 aa22.67■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 GRB2P62993 217 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 GK3PQ14409 553 aa22.67■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 C9orf139Q6ZV77 190 aa22.67■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 DPY19L4Q7Z388 723 aa22.67■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 TEX47Q8TBZ9 253 aa22.67■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 LRGUKQ96M69 825 aa22.67■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 C1orf21Q9H246 121 aa22.67■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 OPA3Q9H6K4 179 aa22.67■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 CTSZQ9UBR2 303 aa22.67■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 C22orf46C9J442 243 aa22.66■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 LGALS8O00214 317 aa22.66■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 CST1P01037 141 aa22.66■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 HKR1P10072 659 aa22.66■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 GRK5P34947 590 aa22.66■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 SLC15A1P46059 708 aa22.66■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 CX3CR1P49238 355 aa22.66■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 BAMBIQ13145 260 aa22.66■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 PRSS45Q7RTY3 260 aa22.66■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa22.66■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 SPERTQ8NA61 448 aa22.66■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 SGK3Q96BR1 496 aa22.66■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 ABHD6Q9BV23 337 aa22.66■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 MARCH7Q9H992 704 aa22.66■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 ARRDC5A6NEK1 342 aa22.65■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 C3orf80F5H4A9 247 aa22.65■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 FAM3AP98173 230 aa22.65■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 ZNF826PQ6ZT77 177 aa22.65■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 OR6N2Q8NGY6 317 aa22.65■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 RNF133Q8WVZ7 376 aa22.65■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 INTS14Q96SY0 518 aa22.65■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 AMELYQ99218 206 aa22.65■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 TOR3AQ9H497 397 aa22.65■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 C1orf123Q9NWV4 160 aa22.65■■□□□ 1.22
LMO1-202ENST00000428101 TRAV40A0A0B4J280 105 aa22.64■■□□□ 1.21
LMO1-202ENST00000428101 H3BN98 237 aa22.64■■□□□ 1.21
LMO1-202ENST00000428101 TBX1O43435 398 aa22.64■■□□□ 1.21
LMO1-202ENST00000428101 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
LMO1-202ENST00000428101 GRPP07492 148 aa22.64■■□□□ 1.21
LMO1-202ENST00000428101 GSTT1P30711 240 aa22.64■■□□□ 1.21
LMO1-202ENST00000428101 DDOSTP39656 456 aa22.64■■□□□ 1.21
LMO1-202ENST00000428101 SLC16A9Q7RTY1 509 aa22.64■■□□□ 1.21
LMO1-202ENST00000428101 TIGD4Q8IY51 512 aa22.64■■□□□ 1.21
LMO1-202ENST00000428101 CANT1Q8WVQ1 401 aa22.64■■□□□ 1.21
LMO1-202ENST00000428101 THTPAQ9BU02 230 aa22.64■■□□□ 1.21
LMO1-202ENST00000428101 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
LMO1-202ENST00000428101 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
LMO1-202ENST00000428101 GLCEO94923 617 aa22.63■■□□□ 1.21
LMO1-202ENST00000428101 EGR1P18146 543 aa22.63■■□□□ 1.21
LMO1-202ENST00000428101 NPY4RP50391 375 aa22.63■■□□□ 1.21
LMO1-202ENST00000428101 OR8B8Q15620 311 aa22.63■■□□□ 1.21
LMO1-202ENST00000428101 KCNJ8Q15842 424 aa22.63■■□□□ 1.21
LMO1-202ENST00000428101 GCSAMQ8N6F7 178 aa22.63■■□□□ 1.21
LMO1-202ENST00000428101 OTULINQ96BN8 352 aa22.63■■□□□ 1.21
LMO1-202ENST00000428101 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
LMO1-202ENST00000428101 REEP6Q96HR9 211 aa22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms