RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 GABRA1P14867 456 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP5-204ENST00000412806 PLA1AQ53H76 456 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP5-204ENST00000412806 Q6ZSR3 168 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF100Q8IYN0 542 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP5-204ENST00000412806 C15orf40Q8WUR7 153 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP5-204ENST00000412806 SGK3Q96BR1 496 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP5-204ENST00000412806 SPACA5Q96QH8 159 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP5-204ENST00000412806 UQCC2Q9BRT2 126 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP5-204ENST00000412806 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
SH3BP5-204ENST00000412806 KLK11Q9UBX7 282 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP5-204ENST00000412806 PRSS50Q9UI38 385 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP5-204ENST00000412806 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
SH3BP5-204ENST00000412806 MYO7BQ6PIF6 2116 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP5-204ENST00000412806 AKAP13Q12802 2813 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP5-204ENST00000412806 A0A096LPE4 126 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP5-204ENST00000412806 A0A1W2PPZ6 126 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP5-204ENST00000412806 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
SH3BP5-204ENST00000412806 SPINK2P20155 84 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP5-204ENST00000412806 AGTR1P30556 359 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP5-204ENST00000412806 FAPQ12884 760 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP5-204ENST00000412806 OR52H1Q8NGJ2 320 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP5-204ENST00000412806 GAL3ST1Q99999 423 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP5-204ENST00000412806 PRDM14Q9GZV8 571 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP5-204ENST00000412806 C12orf49Q9H741 205 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP5-204ENST00000412806 TRAV18A0A075B6X5 111 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 DNM1P46Q6ZS02 220 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 OR2AE1Q8NHA4 323 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 PHF21AQ96BD5 680 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 MARVELD1Q9BSK0 173 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF175Q9Y473 711 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 CENPXA8MT69 81 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 THBS4P35443 961 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 DYRK1AQ13627 763 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF627Q7L945 461 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 AKAP14Q86UN6 197 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 ZADH2Q8N4Q0 377 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 ITPKCQ96DU7 683 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 NPAP1Q9NZP6 1156 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 URB1O60287 2271 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 MT-ND4P03905 459 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 LCATP04180 440 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 FAHP16930 419 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 FOXC1Q12948 553 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 DMRTC1Q5HYR2 192 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 PIGLQ9Y2B2 252 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 HCKP08631 526 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 RAB6AP20340 208 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 QRFPP83859 136 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 PMPCAQ10713 525 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 SSC4DQ8WTU2 575 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 PTX4Q96A99 478 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 REEP6Q96HR9 211 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 AQP7O14520 342 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 BPNT1O95861 308 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 ECDO95905 644 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 ALDOBP05062 364 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 CAPZA1P52907 286 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 GUCA2AQ02747 115 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 UNC119Q13432 240 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 AWAT2Q6E213 333 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 P4HA3Q7Z4N8 544 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 ANGPTL5Q86XS5 388 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 CCDC54Q8NEL0 328 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 DPAGT1Q9H3H5 408 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 CLCF1Q9UBD9 225 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 DOCK7Q96N67 2140 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 HLA-HP01893 362 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 VSIG8P0DPA2 414 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 FCGR2AP12318 317 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 GIFP27352 417 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 OR3A4PP47883 348 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 UBE2V2Q15819 145 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 TATDN3Q17R31 274 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 MOGAT2Q3SYC2 334 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 CDH26Q8IXH8 852 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 CREB3L1Q96BA8 519 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 TAAR6Q96RI8 345 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 GP6Q9HCN6 339 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 HRASLSQ9HDD0 168 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 B3GNT2Q9NY97 397 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 RAB22AQ9UL26 194 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 NHLH1Q02575 133 aa18.79■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 IGFL3Q6UXB1 125 aa18.79■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 PP6455Q8WZ26 134 aa18.79■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 ITFG2Q969R8 447 aa18.79■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 CHST5Q9GZS9 411 aa18.79■□□□□ 0.6
SH3BP5-204ENST00000412806 NOX3Q9HBY0 568 aa18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.9 ms