RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368226.8

PTPRK-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 6,087 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-207ENST00000368226 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 ATPIF1Q9UII2 106 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 A0A087WZY1 265 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 CD3DP04234 171 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 CT62P0C5K7 136 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 CCL4P13236 92 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 CNR1P21554 472 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 ZDHHC16Q969W1 377 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa11.61□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 ALG1L2C9J202 215 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 RFX2P48378 723 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 TMUB2Q71RG4 321 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 TMEM200AQ86VY9 491 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 CDC20BQ86Y33 519 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 BPIFCQ8NFQ6 507 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 OR5H6Q8NGV6 325 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 FBXW5Q969U6 566 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 SOX15O60248 233 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 IGHV3-13P01766 116 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 IGHV3-7P01780 117 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 NKG7Q16617 165 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 RTL8BQ17RB0 113 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 OR2T2Q6IF00 324 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 DTWD2Q8NBA8 298 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 OR4Q3Q8NH05 313 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 MARCH1Q8TCQ1 289 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 SEH1LQ96EE3 360 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 SLC35E1Q96K37 410 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 FOXL2P58012 376 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 INSL4Q14641 139 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 NAA40Q86UY6 237 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 OR52H1Q8NGJ2 320 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 GPBAR1Q8TDU6 330 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 CT55Q8WUE5 264 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 NMES1Q9C002 83 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 LTBP4Q8N2S1 1624 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 RER1O15258 196 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 S100A7P31151 101 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 ZNF266Q14584 549 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 PXT1Q8NFP0 134 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 PHYHIPQ92561 330 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 SCGB1D1O95968 90 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 CD1EP15812 388 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 MGMTP16455 207 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 Q6ZRG5 221 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 C1orf87Q8N0U7 546 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 OR52B4Q8NGK2 314 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 ITPKCQ96DU7 683 aa11.6□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 AQP7P3A6NL99 342 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 XRCC3O43542 346 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 ZXDAP98168 799 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 MOB3BQ86TA1 216 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 ZNF439Q8NDP4 499 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 OR2G2Q8NGZ5 317 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 TTC9Q92623 222 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 OR2F2O95006 317 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 PTHLHP12272 177 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 S100A11P31949 105 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 GALNSP34059 522 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 NDUFA6P56556 154 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 SLC25A19Q9HC21 320 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 TRAV17A0A0B4J275 112 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 FXYD1O00168 92 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 ARPC3O15145 178 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 CRYABP02511 175 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 CA6P23280 308 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 ZNF628Q5EBL2 1059 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 ZNF683Q8IZ20 524 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 A0A1B0GTH9 108 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 IFITM5A6NNB3 132 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 DCTDP32321 178 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 PRDX4Q13162 271 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 PLAC9Q5JTB6 97 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 OSR2Q8N2R0 312 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 SVBPQ8N300 66 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 OR4S1Q8NGB4 309 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 NANPQ8TBE9 248 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 RNF141Q8WVD5 230 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 TVP23CQ96ET8 276 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 PAPPAQ13219 1627 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 IL11RAQ14626 422 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 HAGHQ16775 308 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 ZNF774Q6NX45 483 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 LCN15Q6UWW0 184 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 C17orf107Q6ZR85 190 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 KCNRGQ8N5I3 272 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 NECAP1Q8NC96 275 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 ZNF75AQ96N20 296 aa11.59□□□□□ -0.55
PTPRK-207ENST00000368226 OR2A5Q96R48 311 aa11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms