RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 OR5B21A6NL26 309 aa4.47□□□□□ -1.69
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PTPRD-201ENST00000355233 NAT1P18440 290 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 ACKR3P25106 362 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 UBE3DQ7Z6J8 389 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 MRGPRGQ86SM5 289 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 OR4F15Q8NGB8 312 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 OR10P1Q8NGE3 313 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 IGSF8Q969P0 613 aa4.47□□□□□ -1.69
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PTPRD-201ENST00000355233 CALHM2Q9HA72 323 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
PTPRD-201ENST00000355233 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa4.47□□□□□ -1.69
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PTPRD-201ENST00000355233 CLN5O75503 358 aa4.46□□□□□ -1.69
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PTPRD-201ENST00000355233 F3P13726 295 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 HOXA6P31267 233 aa4.46□□□□□ -1.7
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