RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 RAC2P15153 192 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF12P17014 697 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 SERPINA2P20848 420 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 NEDD8Q15843 81 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 PGGHGQ32M88 737 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 C6orf52Q5T4I8 152 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 SKA3Q8IX90 412 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 OR4M1Q8NGD0 313 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 SLC7A13Q8TCU3 470 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 ADGRG7Q96K78 797 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 RNF122Q9H9V4 155 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM38BQ9NVV0 291 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 NDUFAF4Q9P032 175 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 FAM215AQ9Y5M1 114 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 LOC105371242A0A075B767 164 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 TCF21O43680 179 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 CTAG2O75638 210 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 KNG1P01042 644 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 NRASP01111 189 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 MAS1P04201 325 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 VSIG10L2P0DP72 767 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 OSMP13725 252 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 PRKACAP17612 351 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 ARPC4P59998 168 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 TNK1Q13470 666 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 MADCAM1Q13477 382 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 SLC17A1Q14916 467 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 FXNQ16595 210 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 GABRG1Q8N1C3 465 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 WFDC11Q8NEX6 87 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 UBQLN3Q9H347 655 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 IFT46Q9NQC8 304 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 KIAA1456Q9P272 454 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 SEC14L4Q9UDX3 406 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 A4GNTQ9UNA3 340 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 SSR3Q9UNL2 185 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 GMEB1Q9Y692 573 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC88CQ9P219 2028 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 LAMA1P25391 3075 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0B4J2E0 115 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1B0GX12 115 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 DPRXA6NFQ7 191 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 F5H5P2 479 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 CDIPTO14735 213 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 IDH3BO43837 385 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 NDUFS7O75251 213 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 CSN2P05814 226 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 RAB3AP20336 220 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 SPOCK1Q08629 439 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 FUT5Q11128 374 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 ZP4Q12836 540 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 AWAT2Q6E213 333 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 SLC25A26Q70HW3 274 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 GPR32P1Q8NGA4 272 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC107Q8WV48 283 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 POM121Q96HA1 1249 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 PHB2Q99623 299 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 RSRP1Q9BUV0 290 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 CST11Q9H112 138 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 ENY2Q9NPA8 101 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF639Q9UID6 485 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 B9D1Q9UPM9 204 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 STARD10Q9Y365 291 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 UNC79Q9P2D8 2635 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 SPINT2O43291 252 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 GPRIN2O60269 458 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 CLPTM1O96005 669 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 FREM3P0C091 2139 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 S100A5P33763 92 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 PCYT1AP49585 367 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 GPM6AP51674 278 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 HERV-K104P61576 105 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 LSM3P62310 102 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 GNG3P63215 75 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 GALEQ14376 348 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 BRICD5Q6PL45 260 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 IGFL2Q6UWQ7 119 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 OR2T6Q8NHC8 308 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 OR51E1Q8TCB6 317 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 FAM46BQ96A09 425 aa3.86□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms