RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339298.2

SOCS4-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS4, Length 6,667 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS4-201ENST00000339298 ZNF750Q32MQ0 723 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 SPANXN3Q5MJ09 141 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 OR52E8Q6IFG1 317 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 ZNF880Q6PDB4 577 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 METTL7BQ6UX53 244 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 Q6ZSR9 355 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 AMER3Q8N944 861 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 SUMF1Q8NBK3 374 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 BEND2Q8NDZ0 799 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 DUSP18Q8NEJ0 188 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 OR2M7Q8NG81 312 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 OR1J1Q8NGS3 322 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 OR2T27Q8NH04 317 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 NT5CQ8TCD5 201 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 ST8SIA1Q92185 356 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 FAM168AQ92567 244 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 LPPQ93052 612 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 MRAP2Q96G30 205 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 SOSTQ9BQB4 213 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 TAF9BQ9HBM6 251 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 NAT8Q9UHE5 227 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 PCTPQ9UKL6 214 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 TNFSF18Q9UNG2 199 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 PTPRKQ15262 1439 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 PBRM1Q86U86 1689 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 TMEM89A2RUT3 159 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 C5orf52A6NGY3 159 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 H0YL77 283 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 GABRPO00591 440 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 RBBP9O75884 186 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 GAGE5Q13069 117 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 GAGE6Q13070 117 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 PRDX4Q13162 271 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 ZNF385BQ569K4 471 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 SPIN4Q56A73 249 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 TMEM236Q5W0B7 351 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 ZNF787Q6DD87 383 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 USP17L6PQ6QN14 398 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 TMEM135Q86UB9 458 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 C15orf40Q8WUR7 153 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 UPRTQ96BW1 309 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 EGLN2Q96KS0 407 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 GUCD1Q96NT3 240 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 MUS81Q96NY9 551 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 TMEM70Q9BUB7 260 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 DUSP26Q9BV47 211 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 A4GALTQ9NPC4 353 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 RXFP3Q9NSD7 469 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 RASL12Q9NYN1 266 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 VPS29Q9UBQ0 182 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 ZFP30Q9Y2G7 519 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 HHLA1C9JL84 531 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 M0QXV9 152 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 BCL2L11O43521 198 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 NEURL1O76050 574 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 SHBGP04278 402 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 SRP14P37108 136 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 CNN1P51911 297 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 ZNF136P52737 540 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 LTB4RQ15722 352 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 MST1LQ2TV78 715 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 HLA-BQ31612 363 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 CNTN4Q8IWV2 1026 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 ZFP41Q8N8Y5 198 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 OR4F6Q8NGB9 312 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 DNAJC19Q96DA6 116 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 CMBLQ96DG6 245 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 C5AR2Q9P296 337 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 B3GAT1Q9P2W7 334 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 A0A0D9SG52 128 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 LILRA5A6NI73 299 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 EFSO43281 561 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 PI15O43692 258 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 CEACAM4O75871 244 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 NAPSAO96009 420 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 WNT11O96014 354 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 MT-ND1P03886 318 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 ICAM1P05362 532 aa2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 DBIP07108 87 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SOCS4-201ENST00000339298 GP1BBP13224 206 aa2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms