RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 LIN7BQ9HAP6 207 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 TAS2R4Q9NYW5 299 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC17A2O00624 439 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 WISP2O76076 250 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 TPPPO94811 219 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 UBL3O95164 117 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 DBHP09172 617 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 CD37P11049 281 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 CD79AP11912 226 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 ABOP16442 354 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 CFPP27918 469 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 HTR2CP28335 458 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 INPP1P49441 399 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 IFITM3Q01628 133 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 SPOCK1Q08629 439 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 RIN1Q13671 783 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 GFOD2Q3B7J2 385 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIQKQ629K1 86 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 STEAP3Q658P3 488 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 PYHIN1Q6K0P9 492 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 NAA40Q86UY6 237 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 LYSMD2Q8IV50 215 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 CDH26Q8IXH8 852 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 POC5Q8NA72 575 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 OR1M1Q8NGA1 313 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 OR6M1Q8NGM8 313 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 OR1J2Q8NGS2 313 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 OR5H6Q8NGV6 325 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 OR6K3Q8NGY3 331 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 SETD6Q8TBK2 473 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC7A6Q92536 515 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 ITFG2Q969R8 447 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 PHF21AQ96BD5 680 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 SORCS2Q96PQ0 1159 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 ABCG5Q9H222 651 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 NEK6Q9HC98 313 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 C14orf119Q9NWQ9 140 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF319Q9P2F9 582 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 PRSS50Q9UI38 385 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 NCKAP5O14513 1909 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 CIB4A0PJX0 185 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 DHRS7CA6NNS2 312 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 SULT1B1O43704 296 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 DHRS3O75911 302 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 HLA-HP01893 362 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 TPOP07202 933 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 ADRB1P08588 477 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 CXADRP78310 365 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF79Q15937 498 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 C2orf76Q3KRA6 126 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 GLYATL3Q5SZD4 288 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 TFAP2EQ6VUC0 442 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 Q6ZNX1 250 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 DCDC5Q6ZRR9 648 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 Q6ZT83 130 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 SNX29P2Q8IUI4 249 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 GCNT2Q8N0V5 402 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 CENPSQ8N2Z9 138 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 JAGN1Q8N5M9 183 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 DNAAF1Q8NEP3 725 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 OR1K1Q8NGR3 316 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 OR14K1Q8NGZ2 314 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 FGFBP3Q8TAT2 258 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 LGALS14Q8TCE9 139 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 PP6455Q8WZ26 134 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM3DQ96BQ1 224 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 SGK3Q96BR1 496 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 COX4I2Q96KJ9 171 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 ZFP3Q96NJ6 502 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 UQCC2Q9BRT2 126 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 DIABLOQ9NR28 239 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 OR5V1Q9UGF6 321 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 TUBD1Q9UJT1 453 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A0B4J203 849 aa8.8□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa8.8□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 XRCC2O43543 280 aa8.8□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 IGLV3-1P01715 115 aa8.8□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 SERPINA5P05154 406 aa8.8□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 IL7P13232 177 aa8.8□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 ARSBP15848 533 aa8.8□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.5 ms