RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 BTNL8Q6UX41 500 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF813Q6ZN06 617 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 BPIFCQ8NFQ6 507 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 PELI1Q96FA3 418 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 WNT16Q9UBV4 365 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 A0A0B4J203 849 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 G3V3Y1 287 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 ARPC3O15145 178 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 OR7E24Q6IFN5 339 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 OR52H1Q8NGJ2 320 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 OR5M8Q8NGP6 311 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 CTDSP1Q9GZU7 261 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 COPS3Q9UNS2 423 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 CACNA1CQ13936 2221 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 B3GALNT1O75752 331 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 STAG3L2P0CL84 134 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 OMGP23515 440 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 TIGITQ495A1 244 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 TMEM91Q6ZNR0 172 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 HIST2H3AQ71DI3 136 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 WFDC8Q8IUA0 241 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 C16orf52Q8NHV5 167 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 SORCS2Q96PQ0 1159 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 FBXO34Q9NWN3 711 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 A0A087WUJ7 227 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 FAM166BA8MTA8 275 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 ABCD4O14678 606 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 NTN1O95631 604 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 HTR4Q13639 388 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 FGF14Q92915 247 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 YIPF5Q969M3 257 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 SLC22A11Q9NSA0 550 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 GIPP09681 153 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 DEFA4P12838 97 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 COTL1Q14019 142 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 VASNQ6EMK4 673 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 SLC51BQ86UW2 128 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF680Q8NEM1 530 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 C17orf47Q8NEP4 570 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 CHRDL1Q9BU40 450 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 GSX2Q9BZM3 304 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 A0A1B0GUH1 482 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 TMEM82A0PJX8 343 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 HSPB2A8KAH6 182 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 NTF3P20783 257 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 RANP62826 216 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 HSPB2Q16082 182 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 OR13C9Q8NGT0 318 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 SLC35D1Q9NTN3 355 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 KPTNQ9Y664 436 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 MEIS3P1A6NDR6 274 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 C5orf67F2Z3F1 127 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 XRCC3O43542 346 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 MT-ATP6P00846 226 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 HPNP05981 417 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF718Q3SXZ3 478 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 SLC35D2Q76EJ3 337 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 MRGPREQ86SM8 312 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 FAM181AQ8N9Y4 354 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 SCCPDHQ8NBX0 429 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 DEFB124Q8NES8 71 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 OR10G3Q8NGC4 313 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 DUSP19Q8WTR2 217 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 PTP4A1Q93096 173 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 ABHD1Q96SE0 405 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 G0S2P27469 103 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 PPICP45877 212 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 FAM53BQ14153 422 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 NDUFAF7Q7L592 441 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 C11orf42Q8N5U0 333 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 DERL3Q96Q80 235 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 DDOQ99489 341 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 ARPC5LQ9BPX5 153 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 POMT2Q9UKY4 750 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 USF1P22415 310 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 AMTP48728 403 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 EDDM3BP56851 147 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 OR1D5P58170 312 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 SORDQ00796 357 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 TNK1Q13470 666 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 ZBTB37Q5TC79 503 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 WDR88Q6ZMY6 472 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRG-201ENST00000295874 FAM3DQ96BQ1 224 aa11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms