RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 HSPB2Q16082 182 aa9.52□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 OR2T2Q6IF00 324 aa9.52□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 BTNL8Q6UX41 500 aa9.52□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 Q6ZNB5 142 aa9.52□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 OR4F17Q8NGA8 305 aa9.52□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 OR4F5Q8NH21 305 aa9.52□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 GPR119Q8TDV5 335 aa9.52□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 MISP3Q96FF7 219 aa9.52□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 OR4F4Q96R69 305 aa9.52□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 VN1R1Q9GZP7 353 aa9.52□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 GLRX2Q9NS18 164 aa9.52□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 FAM157AC9JC47 383 aa9.52□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 MBP02144 154 aa9.52□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 H2AFB1P0C5Y9 115 aa9.52□□□□□ -0.89
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TRPS1-201ENST00000220888 SLC25A30Q5SVS4 291 aa9.52□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 LYG1Q8N1E2 194 aa9.52□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 OR10V1Q8NGI7 309 aa9.52□□□□□ -0.89
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TRPS1-201ENST00000220888 SLC35D1Q9NTN3 355 aa9.52□□□□□ -0.89
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TRPS1-201ENST00000220888 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
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TRPS1-201ENST00000220888 SIGLEC11Q96RL6 698 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 TCEAL7Q9BRU2 100 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 POFUT1Q9H488 388 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 POM121CA8CG34 1229 aa9.51□□□□□ -0.89
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TRPS1-201ENST00000220888 S100A8P05109 93 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 COX5AP20674 150 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 EPHA2P29317 976 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 MS4A18Q3C1V0 323 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 HIST2H3AQ71DI3 136 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 ZFAND2BQ8WV99 257 aa9.51□□□□□ -0.89
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TRPS1-201ENST00000220888 MYH10P35580 1976 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa9.51□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF320A2RRD8 509 aa9.51□□□□□ -0.89
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TRPS1-201ENST00000220888 SSSCA1O60232 199 aa9.51□□□□□ -0.89
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TRPS1-201ENST00000220888 V9GYS6 101 aa9.51□□□□□ -0.89
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TRPS1-201ENST00000220888 OR5R1Q8NH85 324 aa9.51□□□□□ -0.89
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TRPS1-201ENST00000220888 PLPPR2Q96GM1 343 aa9.51□□□□□ -0.89
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TRPS1-201ENST00000220888 P2RX3P56373 397 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF90Q03938 601 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 Q1RN00 199 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF260Q3ZCT1 412 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 TRAT1Q6PIZ9 186 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF620Q6ZNG0 422 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 LINC01465Q8N7H1 131 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 NHLRC2Q8NBF2 726 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 MRGPRX3Q96LB0 322 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 RASL11BQ9BPW5 248 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 OR51I2Q9H344 312 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 CYSLTR2Q9NS75 346 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 GAB2Q9UQC2 676 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 A0A087WUJ7 227 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 PPM1DO15297 605 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 OIP5O43482 229 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 CDAP32320 146 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 RAB7AP51149 207 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 CCR9P51686 369 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 PXDC1Q5TGL8 231 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa9.5□□□□□ -0.89
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