RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006275.8

TRAPPC6A-201, Transcript of trafficking protein particle complex 6A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6A, Length 805 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6A-201ENST00000006275 OTOSQ8NHW6 89 aa15.97■□□□□ 0.15
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 C22orf15Q8WYQ4 148 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6A-201ENST00000006275 ELMOD3Q96FG2 381 aa15.97■□□□□ 0.15
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TRAPPC6A-201ENST00000006275 SLC3A1Q07837 685 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 GID4Q8IVV7 300 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 CBR4Q8N4T8 237 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 OR10AD1Q8NGE0 317 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 STMN2Q93045 179 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TIMD4Q96H15 378 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 DUX5Q96PT3 197 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 OR2V2Q96R30 315 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 OPA3Q9H6K4 179 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC6A-201ENST00000006275 TANC2Q9HCD6 1990 aa15.91■□□□□ 0.14
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