RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637548.1

ARID1B-226, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

Gene ARID1B, Length 2,255 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-226	ENST00000637548	ACOX3	O15254	700 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	RS1	O15537	224 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	SCGN	O76038	276 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	NUDT14	O95848	222 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	ADM	P35318	185 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	CD79B	P40259	229 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	TNFSF10	P50591	281 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	SSR4	P51571	173 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	CRISP3	P54108	245 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	MLF1	P58340	268 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	TAS2R60	P59551	318 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	PSPH	P78330	225 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	ARG2	P78540	354 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	MADCAM1	Q13477	382 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	LY6D	Q14210	128 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	KCNMB1	Q16558	191 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	DEF8	Q6ZN54	512 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	SLC5A8	Q8N695	610 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	EXD3	Q8N9H8	876 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	GNRHR2	Q96P88	292 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	DEPP	Q9NTK1	212 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	NDE1	Q9NXR1	346 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	VDAC3	Q9Y277	283 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	NIN	Q8N4C6	2090 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548		A0A1W2PPK0	400 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	RNF222	A6NCQ9	220 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	FAM166B	A8MTA8	275 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	SLC31A2	O15432	143 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	TSPAN2	O60636	221 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	SEMA7A	O75326	666 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	OCM2	P0CE71	109 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	HSD17B1	P14061	328 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	GIF	P27352	417 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	MEOX2	P50222	304 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	ATP5J2	P56134	94 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	ACTB	P60709	375 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	ACTA2	P62736	377 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	ACTG1	P63261	375 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	ACTG2	P63267	376 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	ACTC1	P68032	377 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	ACTA1	P68133	377 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	VLDLR	P98155	873 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	OR1C1	Q15619	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	VAMP3	Q15836	100 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	MEP1A	Q16819	746 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	SLC34A3	Q8N130	599 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	OR6T1	Q8NGN1	323 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	AGAP4	Q96P64	663 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	STAC	Q99469	402 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ARID1B-226	ENST00000637548	SVIL	O95425	2214 aa		4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms