RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589585.1

CTIF-207, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 4

Gene CTIF, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-207ENST00000589585 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 GLYATL3Q5SZD4 288 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 LCN1P1Q5VSP4 162 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 FAM166AQ6J272 317 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 OTOSQ8NHW6 89 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 RNF133Q8WVZ7 376 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 ITLN1Q8WWA0 313 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 RAB1CQ92928 201 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 OR2V2Q96R30 315 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 TEAD3Q99594 435 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 MDFIQ99750 246 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 SLC30A2Q9BRI3 323 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 OSBPL10Q9BXB5 764 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 TOR3AQ9H497 397 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 BRD7Q9NPI1 651 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 TMEM100Q9NV29 134 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 IL19Q9UHD0 177 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 LAMP5Q9UJQ1 280 aa11.63□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 JMJD1CQ15652 2540 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 ISPDA4D126 451 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 CCDC182A6NF36 153 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 GGT3PA6NGU5 568 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 H0YL77 283 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 LMX1BO60663 402 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 CRLF1O75462 422 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 APOC1P02654 83 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 HLA-DPB1P04440 258 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 ANOS1P23352 680 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 RBMXP38159 391 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 OPRL1P41146 370 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 SLC3A1Q07837 685 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 C12orf73Q69YU5 71 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 FAM57BQ71RH2 274 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 SLC16A9Q7RTY1 509 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 KCNS2Q9ULS6 477 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 WIPI2Q9Y4P8 454 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 ORC6Q9Y5N6 252 aa11.62□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 CD300LBA8K4G0 201 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 F5H5P2 479 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 SRP9P49458 86 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 RAD23AP54725 363 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 GFOD2Q3B7J2 385 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 LRRN1Q6UXK5 716 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 RHOUQ7L0Q8 258 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 LINC01356Q8N9X3 169 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 TMEM163Q8TC26 289 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 MEGF10Q96KG7 1140 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 GABARAPL3Q9BY60 117 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 YIPF3Q9GZM5 350 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 SP140LQ9H930 580 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 LPAR2Q9HBW0 351 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 S100A14Q9HCY8 104 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 TMEM106BQ9NUM4 274 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 DCAF16Q9NXF7 216 aa11.61□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 MXRA5Q9NR99 2828 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 SLC22A31A6NKX4 558 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 PSMD9O00233 223 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 EI24O14681 340 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 MLNRO43193 412 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 XRCC2O43543 280 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 SBK2P0C263 348 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 ALOX5APP20292 161 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 CA6P23280 308 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 CDH15P55291 814 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 LMO4P61968 165 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 EFNB1P98172 346 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 OR8G1Q15617 311 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 TIGD6Q17RP2 521 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 CHRFAM7AQ494W8 412 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 AADACL4Q5VUY2 407 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 NXNL2Q5VZ03 156 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 KRT77Q7Z794 578 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 OR52H1Q8NGJ2 320 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 SGK3Q96BR1 496 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 REEP6Q96HR9 211 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 PGAM5Q96HS1 289 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 GAL3ST1Q99999 423 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 SHARPINQ9H0F6 387 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 OR10A2Q9H208 303 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 OPA3Q9H6K4 179 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 GCM1Q9NP62 436 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 UBAP1Q9NZ09 502 aa11.6□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 B4DSR2 109 aa11.59□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 BAG2O95816 211 aa11.59□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 ALPLP05186 524 aa11.59□□□□□ -0.55
CTIF-207ENST00000589585 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms