RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589537.1

NFIC-208, Transcript of nuclear factor I C, human

TSL 2

Gene NFIC, Length 977 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFIC-208	ENST00000589537	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	CD300LB	A8K4G0	201 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537		A8MXK9	166 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	XRCC2	O43543	280 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	GLCE	O94923	617 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	OSM	P13725	252 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	CD200	P41217	278 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	RASSF2	P50749	326 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	CBX1	P83916	185 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	ESCO2	Q56NI9	601 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	NAA40	Q86UY6	237 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	KLB	Q86Z14	1044 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	SPERT	Q8NA61	448 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	ZNF511	Q8NB15	262 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	NANP	Q8TBE9	248 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	NRBF2	Q96F24	287 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	INTS14	Q96SY0	518 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	OCEL1	Q9H607	264 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	MARCH7	Q9H992	704 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	CENPM	Q9NSP4	180 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		13.98	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	GGT3P	A6NGU5	568 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537		F5H5P2	479 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537		H0YL77	283 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	PRODH	O43272	600 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	GMDS	O60547	372 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	FKBP6	O75344	327 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	CLU	P10909	449 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	POU1F1	P28069	291 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	GSTT1	P30711	240 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	DDOST	P39656	456 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	LCN2	P80188	198 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	MZT1	Q08AG7	82 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	USP43	Q70EL4	1123 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537		Q8TCH9	128 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	MIOX	Q9UGB7	285 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	DYSF	O75923	2080 aa		13.97	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	FAM183A	A6NL82	134 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	ATP5H	O75947	161 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	EPHA1	P21709	976 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	HSD11B1	P28845	292 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	PRKX	P51817	358 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	ZNF92	Q03936	586 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	GINS1	Q14691	196 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	OR8G1	Q15617	311 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	SNCB	Q16143	134 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	OTULIN	Q96BN8	352 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	JMJD8	Q96S16	334 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		13.96	□□□□□ -0.17
NFIC-208	ENST00000589537	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	PSKH1	P11801	424 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	CX3CR1	P49238	355 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	CDK5	Q00535	292 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	BNIP1	Q12981	228 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	MAB21L1	Q13394	359 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	KCNJ8	Q15842	424 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	TIGD4	Q8IY51	512 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	SPSB4	Q96A44	273 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	MRI1	Q9BV20	369 aa		13.95	□□□□□ -0.18
NFIC-208	ENST00000589537	ABHD6	Q9BV23	337 aa		13.95	□□□□□ -0.18

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