RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 C12orf49Q9H741 205 aa25.45■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 RHBDL2Q9NX52 303 aa25.45■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 E9PLN8 166 aa25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 CTDSPLO15194 276 aa25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANOS1P23352 680 aa25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 MMP15P51511 669 aa25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 HACD4Q5VWC8 232 aa25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC25A28Q96A46 364 aa25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 RFT1Q96AA3 541 aa25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 SORCS2Q96PQ0 1159 aa25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 DKK4Q9UBT3 224 aa25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRSS50Q9UI38 385 aa25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 DHRS3O75911 302 aa25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 TPPPO94811 219 aa25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 RANBP1P43487 201 aa25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 POU3F4P49335 361 aa25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 GLYATL3Q5SZD4 288 aa25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 C9orf135Q5VTT2 229 aa25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 JAGN1Q8N5M9 183 aa25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 C10orf35Q96D05 121 aa25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 LYZL4Q96KX0 146 aa25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 SOX7Q9BT81 388 aa25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 V9GYS6 101 aa25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 AHRRA9YTQ3 701 aa25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 SULT1B1O43704 296 aa25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 WISP2O76076 250 aa25.43■■□□□ 1.66
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ABOP16442 354 aa25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 MPGP29372 298 aa25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 C2orf76Q3KRA6 126 aa25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 DPPA2Q7Z7J5 298 aa25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 LYPD6Q86Y78 171 aa25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 C15orf40Q8WUR7 153 aa25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 WNT2BQ93097 391 aa25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC22A4Q9H015 551 aa25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF224Q9NZL3 707 aa25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 FREM1Q5H8C1 2179 aa25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 RRP8O43159 456 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 PFDN1O60925 122 aa25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 ADRB1P08588 477 aa25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 SFRP5Q5T4F7 317 aa25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 CDH26Q8IXH8 852 aa25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR13C9Q8NGT0 318 aa25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 UQCC2Q9BRT2 126 aa25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF391Q9UJN7 358 aa25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 A0A096LPE4 126 aa25.41■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 A0A1W2PPZ6 126 aa25.41■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 C5orf63A6NC05 138 aa25.41■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 COX5BP10606 129 aa25.41■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 THBS4P35443 961 aa25.41■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARR3P36575 388 aa25.41■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 MNDAP41218 407 aa25.41■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 K7ENP7 123 aa25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARSBP15848 533 aa25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.669e-6■■■■■ 27.7
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CTDNEP1-208ENST00000573600 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM214BQ7L5A3 538 aa25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR5M9Q8NGP3 310 aa25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 SGK3Q96BR1 496 aa25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZFP3Q96NJ6 502 aa25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 LHX6Q9UPM6 363 aa25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 MED12LQ86YW9 2145 aa25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLA2G10O15496 165 aa25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 LCATP04180 440 aa25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM69Q5SWH9 247 aa25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR2A2Q6IF42 318 aa25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM53Q6P2H8 277 aa25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANKRD16Q6P6B7 361 aa25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 NRARPQ7Z6K4 114 aa25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRIM63Q969Q1 353 aa25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 FUOMA2VDF0 154 aa25.39■■□□□ 1.65
CTDNEP1-208ENST00000573600 DHRS7CA6NNS2 312 aa25.39■■□□□ 1.65
CTDNEP1-208ENST00000573600 K7EM74 188 aa25.39■■□□□ 1.65
CTDNEP1-208ENST00000573600 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPNP16150 400 aa25.39■■□□□ 1.65
CTDNEP1-208ENST00000573600 BCAP31P51572 246 aa25.39■■□□□ 1.65
CTDNEP1-208ENST00000573600 HGFACQ04756 655 aa25.39■■□□□ 1.65
CTDNEP1-208ENST00000573600 GUSBP1Q15486 140 aa25.39■■□□□ 1.65
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
CTDNEP1-208ENST00000573600 MZT2BQ6NZ67 158 aa25.39■■□□□ 1.65
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR52N4Q8NGI2 321 aa25.39■■□□□ 1.65
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR1K1Q8NGR3 316 aa25.39■■□□□ 1.65
CTDNEP1-208ENST00000573600 PP6455Q8WZ26 134 aa25.39■■□□□ 1.65
CTDNEP1-208ENST00000573600 RGCCQ9H4X1 137 aa25.39■■□□□ 1.65
CTDNEP1-208ENST00000573600 AKAP13Q12802 2813 aa25.38■■□□□ 1.65
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa25.38■■□□□ 1.65
CTDNEP1-208ENST00000573600 ALDOBP05062 364 aa25.38■■□□□ 1.65
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