RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566600.1

NME3-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene NME3, Length 913 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-209ENST00000566600 PRSS45Q7RTY3 260 aa22.28■■□□□ 1.16
NME3-209ENST00000566600 OR10H4Q8NGA5 316 aa22.28■■□□□ 1.16
NME3-209ENST00000566600 UBASH3BQ8TF42 649 aa22.28■■□□□ 1.16
NME3-209ENST00000566600 FAM168AQ92567 244 aa22.28■■□□□ 1.16
NME3-209ENST00000566600 PGAM5Q96HS1 289 aa22.28■■□□□ 1.16
NME3-209ENST00000566600 DECR2Q9NUI1 292 aa22.28■■□□□ 1.16
NME3-209ENST00000566600 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa22.28■■□□□ 1.16
NME3-209ENST00000566600 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa22.27■■□□□ 1.16
NME3-209ENST00000566600 IQCF6A8MYZ5 107 aa22.27■■□□□ 1.16
NME3-209ENST00000566600 H0YJX3 145 aa22.27■■□□□ 1.16
NME3-209ENST00000566600 NDUFS8O00217 210 aa22.27■■□□□ 1.16
NME3-209ENST00000566600 CAPGP40121 348 aa22.27■■□□□ 1.16
NME3-209ENST00000566600 ZNF92Q03936 586 aa22.27■■□□□ 1.16
NME3-209ENST00000566600 CDK5R2Q13319 367 aa22.27■■□□□ 1.16
NME3-209ENST00000566600 TIGD6Q17RP2 521 aa22.27■■□□□ 1.16
NME3-209ENST00000566600 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
NME3-209ENST00000566600 OR8G5Q8NG78 346 aa22.27■■□□□ 1.16
NME3-209ENST00000566600 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
NME3-209ENST00000566600 SPSB4Q96A44 273 aa22.27■■□□□ 1.16
NME3-209ENST00000566600 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
NME3-209ENST00000566600 EGLN1Q9GZT9 426 aa22.27■■□□□ 1.16
NME3-209ENST00000566600 RGCCQ9H4X1 137 aa22.27■■□□□ 1.16
NME3-209ENST00000566600 MSL2Q9HCI7 577 aa22.27■■□□□ 1.16
NME3-209ENST00000566600 AASSQ9UDR5 926 aa22.27■■□□□ 1.16
NME3-209ENST00000566600 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa22.27■■□□□ 1.16
NME3-209ENST00000566600 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa22.26■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 PSMD9O00233 223 aa22.26■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 SPRY3O43610 288 aa22.26■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 APOL3O95236 402 aa22.26■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 IGHV1-46P01743 117 aa22.26■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 KRT8P05787 483 aa22.26■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 TNFSF4P23510 183 aa22.26■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 MAGEB1P43366 347 aa22.26■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 OR5AS1Q8N127 324 aa22.26■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 ZNF786Q8N393 782 aa22.26■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 RFLNBQ8N5W9 214 aa22.26■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 OR13G1Q8NGZ3 307 aa22.26■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 OR2AE1Q8NHA4 323 aa22.26■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 TBX5Q99593 518 aa22.26■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 TTTY10Q9BZA0 68 aa22.26■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 BRD7Q9NPI1 651 aa22.26■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa22.25■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 DBTP11182 482 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 CD99P14209 185 aa22.25■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 CCL8P80075 99 aa22.25■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 ZNF91Q05481 1191 aa22.25■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 TNK1Q13470 666 aa22.25■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 TSTQ16762 297 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 C10orf105Q8TEF2 133 aa22.25■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 NRG4Q8WWG1 115 aa22.25■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 RDH5Q92781 318 aa22.25■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 SGK3Q96BR1 496 aa22.25■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 REEP6Q96HR9 211 aa22.25■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 TMUB1Q9BVT8 246 aa22.25■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 ZNF391Q9UJN7 358 aa22.25■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 HIVEP1P15822 2718 aa22.24■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 C5orf63A6NC05 138 aa22.24■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 TRIM64A6NGJ6 449 aa22.24■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 GGT3PA6NGU5 568 aa22.24■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 TRIM64BA6NI03 449 aa22.24■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 PRR32B1ATL7 298 aa22.24■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 CLIC3O95833 236 aa22.24■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 HPXP02790 462 aa22.24■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 CD55P08174 381 aa22.24■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 SLC25A16P16260 332 aa22.24■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 MMP16P51512 607 aa22.24■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 CARTPTQ16568 116 aa22.24■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa22.24■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 ZNF540Q8NDQ6 660 aa22.24■■□□□ 1.15
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NME3-209ENST00000566600 SAP30LQ9HAJ7 183 aa22.24■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 CD300LBA8K4G0 201 aa22.23■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 J3QRE1 110 aa22.23■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 SULT1C4O75897 302 aa22.23■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 NCR1O76036 304 aa22.23■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 FADS2O95864 444 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 FOSL1P15407 271 aa22.23■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 DDOSTP39656 456 aa22.23■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 RAB40BQ12829 278 aa22.23■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 KLHL22Q53GT1 634 aa22.23■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 Q6ZR03 302 aa22.23■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 BHLHE23Q8NDY6 225 aa22.23■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 OR2Z1Q8NG97 314 aa22.23■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 LGALS12Q96DT0 336 aa22.23■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 ELMOD3Q96FG2 381 aa22.23■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 SLC30A2Q9BRI3 323 aa22.23■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 PIMREGQ9BSJ6 248 aa22.23■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 SLC22A4Q9H015 551 aa22.23■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 MOB1AQ9H8S9 216 aa22.23■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 TMEM100Q9NV29 134 aa22.23■■□□□ 1.15
NME3-209ENST00000566600 FAM206AQ9NX38 181 aa22.23■■□□□ 1.15
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