RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549815.1

GCN1-206, Transcript of GCN1, eIF2 alpha kinase activator homolog, human

TSL 3

Gene GCN1, Length 543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCN1-206	ENST00000549815	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	SPTSSA	Q969W0	71 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	MRI1	Q9BV20	369 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	LRRC30	A6NM36	301 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	CD300LB	A8K4G0	201 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815		B2RBV5	119 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	FAM20B	O75063	409 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	MNAT1	P51948	309 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	SLC25A1	P53007	311 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	GNB2	P62879	340 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	CRMP1	Q14194	572 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	MPPED2	Q15777	294 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	TEX30	Q5JUR7	227 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	DRAM2	Q6UX65	266 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	UPRT	Q96BW1	309 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	NSL1	Q96IY1	281 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	MUC13	Q9H3R2	512 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GCN1-206	ENST00000549815	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	PLAT	P00750	562 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	GYPB	P06028	91 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	T-ENOL	P0DO92	83 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	HKR1	P10072	659 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	CLU	P10909	449 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	SPI1	P17947	270 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	CA6	P23280	308 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	PRTN3	P24158	256 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	PSMB10	P40306	273 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	ENTPD1	P49961	510 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	MICA	Q29983	383 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	AWAT1	Q58HT5	328 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	ZNF511	Q8NB15	262 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	OR2T29	Q8NH02	315 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	OR8B2	Q96RD0	313 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	KCNJ15	Q99712	375 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	SLC22A4	Q9H015	551 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	GMDS	O60547	372 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	SOX14	O95416	240 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	SPARC	P09486	303 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	IRF2	P14316	349 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	FMO3	P31513	532 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	PITPNB	P48739	271 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	PRKX	P51817	358 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	OR8G1	Q15617	311 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	DHFR2	Q86XF0	187 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	PARP8	Q8N3A8	854 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	OR2T33	Q8NG76	320 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	SPSB4	Q96A44	273 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815		U3KQV3	271 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	DHRS12	A0PJE2	317 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	GGT3P	A6NGU5	568 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	C22orf46	C9J442	243 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	ZNF878	C9JN71	531 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	CLDN34	H7C241	214 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	PHYH	O14832	338 aa		11.18	□□□□□ -0.62

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