RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541869.5

POLR1B-217, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR1B, Length 5,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-217ENST00000541869 HAAOP46952 286 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 RAE1P78406 368 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 Q6ZTK2 550 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 CDH24Q86UP0 819 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SFTPA2Q8IWL1 248 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 ACBD4Q8NC06 268 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 DYNLRB2Q8TF09 96 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 GRAMD2BQ96HH9 432 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 PCGF1Q9BSM1 259 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 NRIP3Q9NQ35 241 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 EHFQ9NZC4 300 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 PITPNC1Q9UKF7 332 aa9.23□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 A0A1W2PRD5 423 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 A0A1W2PRF3 423 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 A0A1W2PRM7 423 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 MSTNO14793 375 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SBK3P0C264 359 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 NBL1P41271 181 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 FUT7Q11130 342 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SKP2Q13309 424 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF74Q16587 644 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 NUDT8Q8WV74 236 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF696Q9H7X3 374 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 ELOVL5Q9NYP7 299 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 TRAPPC4Q9Y296 219 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 ALG5Q9Y673 324 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 TRAV6A0A075B6T7 132 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 ACOD1A6NK06 481 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 IFNL4K9M1U5 179 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 VEGFCP49767 419 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 ADAM5Q6NVV9 412 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 CORO6Q6QEF8 472 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 OR6M1Q8NGM8 313 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 OR13D1Q8NGV5 346 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 LRRC29Q8WV35 223 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF416Q9BWM5 594 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 BEX1Q9HBH7 125 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 A0A0A6YYH2 397 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 MEIOCA2RUB1 952 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 NAP1L6A6NFF2 107 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 A6NJ64 397 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 C9orf172C9J069 976 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 AKAIN1P0CW23 69 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM11P17152 192 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 RAP2BP61225 183 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SYT9Q86SS6 491 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 UBAC2Q8NBM4 344 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 OR51E1Q8TCB6 317 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 FUNDC2Q9BWH2 189 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 C1orf123Q9NWV4 160 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 THYN1Q9P016 225 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 NBASA2RRP1 2371 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 CYR61O00622 381 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 CSF3P09919 207 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 H2AFB2P0C5Z0 115 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 PF4V1P10720 104 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 CSF2RBP32927 897 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SLC37A1P57057 533 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 OR2G6Q5TZ20 316 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 TFAP2EQ6VUC0 442 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 ISOC1Q96CN7 298 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 PLPPR2Q96GM1 343 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SLC35E1Q96K37 410 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 ARHGDIGQ99819 225 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 RASL11BQ9BPW5 248 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 CXXC4Q9H2H0 198 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SBF1O95248 1867 aa9.21□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 A0A1W2PPV4 95 aa9.21□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 CT62P0C5K7 136 aa9.21□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 ERHP84090 104 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 EGR3Q06889 387 aa9.21□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 DRAM2Q6UX65 266 aa9.21□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 PLXDC2Q6UX71 529 aa9.21□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF679Q8IYX0 411 aa9.21□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 C17orf47Q8NEP4 570 aa9.21□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 OR52N1Q8NH53 320 aa9.21□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 RSRP1Q9BUV0 290 aa9.21□□□□□ -0.93
POLR1B-217ENST00000541869 SLC52A3Q9NQ40 469 aa9.21□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms