RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 SMCO3A2RU48 225 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 F5H697 171 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 AIPO00170 330 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 RGS14O43566 566 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 TRIAP1O43715 76 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 SCRG1O75711 98 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 PIAS1O75925 651 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 SLCO2B1O94956 709 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 PDYNP01213 254 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 JCHAINP01591 159 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 RAB40ALP0C0E4 278 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 EBLN1P0CF75 366 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 T-ENOLP0DO92 83 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 SPP1P10451 314 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 NR2F6P10588 404 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 TBXA2RP21731 343 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 S100A2P29034 98 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 SSTR5P35346 364 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 PBX1P40424 430 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 AQP2P41181 271 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 EVX1P49640 407 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 TDGF1P3P51864 188 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 OR4D2P58180 307 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 MAXP61244 160 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 RAB1AP62820 205 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 FAM3AP98173 230 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 GPR18Q14330 331 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 FCN2Q15485 313 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 DGUOKQ16854 277 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 LCN10Q6JVE6 187 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 SERPINA9Q86WD7 417 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 TEX26Q8N6G2 289 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 TMEM185AQ8NFB2 350 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 RHOXF1Q8NHV9 184 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 CTHRC1Q96CG8 243 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 PERPQ96FX8 193 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 DCUN1D1Q96GG9 259 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 LINC00052Q96N35 136 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 MCEEQ96PE7 176 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 PCDHAC1Q9H158 963 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 CHST8Q9H2A9 424 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 ANKRA2Q9H9E1 313 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 LYRM4Q9HD34 91 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 FBXO5Q9UKT4 447 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 HSPB11Q9Y547 144 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 CIB4A0PJX0 185 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 HYKKA2RU49 373 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 H7C417 338 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 SNAI2O43623 268 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 TCF21O43680 179 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 OR2C1O95371 312 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 FTH1P02794 183 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 ADORA3P0DMS8 318 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 SLC2A5P22732 501 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 KDELR2P33947 212 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 PMELP40967 661 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 RBM34P42696 430 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 TTPAP49638 278 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 DHODHQ02127 395 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 GTF2H2Q13888 395 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 MAPK11Q15759 364 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 TAF9Q16594 264 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 POU2AF1Q16633 256 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 FNBP1LQ5T0N5 605 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 FAM45BPQ6NSW5 357 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 ZNF774Q6NX45 483 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 FAM198BQ6UWH4 519 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 Q6ZS92 163 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 MON1BQ7L1V2 547 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 KCNMB4Q86W47 210 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 OR10K1Q8NGX5 313 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 OR2T11Q8NH01 316 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 FAM45AQ8TCE6 357 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 ASB17Q8WXJ9 295 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 TMEM45BQ96B21 275 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 TSSK3Q96PN8 268 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-212ENST00000535535 NPAS2Q99743 824 aa6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms