RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPEF1Q9Y4P9 236 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CEPT1Q9Y6K0 416 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ATRXP46100 2492 aa7.36□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SHANK1Q9Y566 2161 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A0U1RQV5 110 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A1B0GTI1 187 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DPRXA6NFQ7 191 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GGT3PA6NGU5 568 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF879B4DU55 563 aa7.35□□□□□ -1.23
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF12P17014 697 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF20P17024 532 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ACHEP22303 614 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ANOS1P23352 680 aa7.35□□□□□ -1.23
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PTAFRP25105 342 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CALCRP30988 508 aa7.35□□□□□ -1.23
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMBIM6P55061 237 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PPP1CBP62140 327 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TFF3Q07654 80 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 INSL4Q14641 139 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 Q499Y3 187 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPATA46Q5T0L3 261 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C22orf42Q6IC83 251 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PAMR1Q6UXH9 720 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM91Q6ZNR0 172 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 COLCA1Q6ZS62 124 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DOK3Q7L591 496 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF101Q8IZC7 436 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR51A4Q8NGJ6 313 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR1J1Q8NGS3 322 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FGGYQ96C11 551 aa7.35□□□□□ -1.23
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR14A2Q96R54 314 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RGCCQ9H4X1 137 aa7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ATMQ13315 3056 aa7.35□□□□□ -1.23
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PLA2G2AP14555 144 aa7.34□□□□□ -1.23
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PCSK6P29122 969 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GNALP38405 381 aa7.34□□□□□ -1.23
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MAP2K3P46734 347 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GSK3AP49840 483 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRSS12P56730 875 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 VBP1P61758 197 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NCS1P62166 190 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BSPH1Q075Z2 132 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HSD17B12Q53GQ0 312 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZMAT1Q5H9K5 638 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 VHLLQ6RSH7 139 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC22A25Q6T423 547 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa7.34□□□□□ -1.23
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PGAP1Q75T13 922 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCDC54Q8NEL0 328 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC25A40Q8TBP6 338 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RAB2BQ8WUD1 216 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PHYHIPQ92561 330 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ISOC1Q96CN7 298 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CMBLQ96DG6 245 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PLPPR2Q96GM1 343 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LYZL4Q96KX0 146 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KCTD7Q96MP8 289 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DACH2Q96NX9 599 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SOX7Q9BT81 388 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CENPOQ9BU64 300 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BCL2L14Q9BZR8 327 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR2J1Q9GZK6 312 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM192AQ9GZU8 254 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 POFUT1Q9H488 388 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RNF167Q9H6Y7 350 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PLEKHA1Q9HB21 404 aa7.34□□□□□ -1.23
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