RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524238.3

HMBOX1-211, Transcript of homeobox containing 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HMBOX1, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1-211ENST00000524238 C8orf44Q96CB5 159 aa6.73□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 PRRX2Q99811 253 aa6.73□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 C5orf66Q9H5L9 145 aa6.73□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 CAPN10Q9HC96 672 aa6.73□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 DCAF16Q9NXF7 216 aa6.73□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 GDE1Q9NZC3 331 aa6.73□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 TUBD1Q9UJT1 453 aa6.73□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 PILRAQ9UKJ1 303 aa6.73□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 OR52A1Q9UKL2 312 aa6.73□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 NSG2Q9Y328 171 aa6.73□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 LRP12Q9Y561 859 aa6.73□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 POM121BA6NF01 834 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF860A6NHJ4 632 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM14DPA8MWL7 114 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 PRRT4C9JH25 899 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 SCDO00767 359 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 GPR37O15354 613 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 DEDDO75618 318 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 ADAP1O75689 374 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 PNPP00491 289 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 IGHMP01871 453 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 RNH1P13489 461 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF823P16415 610 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 EMP2P54851 167 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC26A5P58743 744 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 SPCS3P61009 180 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 RPS21P63220 83 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF117Q03924 483 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 FOXO1Q12778 655 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 PPA1Q15181 289 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC9A3R2Q15599 337 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 SGCBQ16585 318 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 PYY3Q5JQD4 70 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 NCMAPQ5T1S8 102 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 TCEAL6Q6IPX3 200 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 BCORP1Q8N888 145 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 SUMF2Q8NBJ7 301 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 OR4D6Q8NGJ1 314 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 CD300LFQ8TDQ1 290 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM230Q96A57 120 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 ISOC2Q96AB3 205 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 GALNT14Q96FL9 552 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 LURAP1Q96LR2 239 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 IP6K3Q96PC2 410 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 MOGAT1Q96PD6 335 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 OR2M4Q96R27 311 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 SSX3Q99909 188 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 GINS3Q9BRX5 216 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 RSRP1Q9BUV0 290 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 ABHD6Q9BV23 337 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 C19orf12Q9NSK7 152 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 FBXL17Q9UF56 701 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 TCFL5Q9UL49 500 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa6.72□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 TET1Q8NFU7 2136 aa6.71□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 EML5Q05BV3 1969 aa6.71□□□□□ -1.33
HMBOX1-211ENST00000524238 A6NIZ1 184 aa6.71□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 B4DEV8 164 aa6.71□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 C9JQL5 133 aa6.71□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 H0YGG7 62 aa6.71□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 H3BSH0 61 aa6.71□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa6.71□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 H7C1C5 153 aa6.71□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 CLDN4O14493 209 aa6.71□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF217O75362 1048 aa6.71□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 TIMP1P01033 207 aa6.71□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 CD63P08962 238 aa6.71□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 VSIG8P0DPA2 414 aa6.71□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 CEBPBP17676 345 aa6.71□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 DDTP30046 118 aa6.71□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 GDI1P31150 447 aa6.71□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 GALNSP34059 522 aa6.71□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 ACTR1BP42025 376 aa6.71□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 P2RY1P47900 373 aa6.71□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 NDUFA6P56556 154 aa6.71□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM33P57088 247 aa6.71□□□□□ -1.34
HMBOX1-211ENST00000524238 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms