RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522995.1

CEP170-223, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 3

Gene CEP170, Length 608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-223	ENST00000522995	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	DIRC2	Q96SL1	478 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	TOR3A	Q9H497	397 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	CHODL	Q9H9P2	273 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	TREM2	Q9NZC2	230 aa		13.24	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	PSMD9	O00233	223 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	TBX1	O43435	398 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	LILRA1	O75019	489 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	CRYBB2	P43320	205 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	CDC42	P60953	191 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	FAM209A	Q5JX71	171 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	FAM57B	Q71RH2	274 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	OR8G5	Q8NG78	346 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	MBOAT4	Q96T53	435 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	CACNG2	Q9Y698	323 aa		13.23	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995		H0YL77	283 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	APOC1	P02654	83 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	ADH4	P08319	380 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	ANPEP	P15144	967 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	SELE	P16581	610 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	ACHE	P22303	614 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	TNFSF4	P23510	183 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	TMEM33	P57088	247 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	TRIP10	Q15642	601 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	KRT77	Q7Z794	578 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	GID4	Q8IVV7	300 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	CCL17	Q92583	94 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	SGK3	Q96BR1	496 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	TMEM100	Q9NV29	134 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	COPS3	Q9UNS2	423 aa		13.22	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	LRP5L	A4QPB2	252 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	ERICH4	A6NGS2	130 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	GGT3P	A6NGU5	568 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	RP2	O75695	350 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	CD55	P08174	381 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	HTR1F	P30939	366 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	RCN1	Q15293	331 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	HFE	Q30201	348 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	LPCAT4	Q643R3	524 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	PGAM5	Q96HS1	289 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	SP140L	Q9H930	580 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	AASS	Q9UDR5	926 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	LRP12	Q9Y561	859 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		13.21	□□□□□ -0.29
CEP170-223	ENST00000522995	CD300LB	A8K4G0	201 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CEP170-223	ENST00000522995	PRR32	B1ATL7	298 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CEP170-223	ENST00000522995		E9PQ18	207 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CEP170-223	ENST00000522995	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
CEP170-223	ENST00000522995	ENTPD6	O75354	484 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CEP170-223	ENST00000522995	APOL3	O95236	402 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CEP170-223	ENST00000522995	HLA-DPB1	P04440	258 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CEP170-223	ENST00000522995	SBK2	P0C263	348 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CEP170-223	ENST00000522995	MVK	Q03426	396 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CEP170-223	ENST00000522995	TIGD6	Q17RP2	521 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CEP170-223	ENST00000522995	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CEP170-223	ENST00000522995	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CEP170-223	ENST00000522995	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CEP170-223	ENST00000522995	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		13.2	□□□□□ -0.3
CEP170-223	ENST00000522995	APOL4	Q9BPW4	351 aa		13.2	□□□□□ -0.3

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.9 ms