RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	GALNT16	Q8N428	558 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	OR51F2	Q8NH61	342 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	C14orf79	Q96F83	325 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	KIF25	Q9UIL4	384 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	LILRA5	A6NI73	299 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	METTL12	A8MUP2	240 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	IMPA2	O14732	288 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	CXCL13	O43927	109 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	CTAG2	O75638	210 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	OR5H8	P0DN80	308 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	SELENOP	P49908	381 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	FOXK1	P85037	733 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	RNLS	Q5VYX0	342 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	FAM166B	A8MTA8	275 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	CER1	O95813	267 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	CYB561	P49447	251 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ERVK-16	P61578	105 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	TERB2	Q8NHR7	220 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	OXGR1	Q96P68	337 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	OGG1	O15527	345 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	SPINT1	O43278	529 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	XRCC2	O43543	280 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	IFNA4	P05014	189 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	DHRS2	Q13268	280 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF141	Q15928	474 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	RDH5	Q92781	318 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1W2PPV4	95 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	OR6C76	A6NM76	312 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193		K7EQS6	105 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	DHH	O43323	396 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	CLDN1	O95832	211 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	SERPINA7	P05543	415 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	SRF	P11831	508 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	FOLR1	P15328	257 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF250	P15622	560 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	MYBPH	Q13203	477 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193		Q6ZRG5	221 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	FBXW5	Q969U6	566 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	VSTM2L	Q96N03	204 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	C12orf49	Q9H741	205 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	NCOR1	O75376	2440 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193		A0A096LPE4	126 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1W2PPZ6	126 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	CYR61	O00622	381 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	HSD17B6	O14756	317 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	HS3ST1	O14792	307 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	RER1	O15258	196 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	ACTL6B	O94805	426 aa		7.23	□□□□□ -1.25
NEK1-208	ENST00000512193	NXPH2	O95156	264 aa		7.23	□□□□□ -1.25

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