RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPATC1	Q76KD6	591 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	COPS4	Q9BT78	406 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	ABHD6	Q9BV23	337 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM100	Q9NV29	134 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF878	C9JN71	531 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	E2F6	O75461	281 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	TIPRL	O75663	272 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF205	O95201	554 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	FSHB	P01225	129 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC2A5	P22732	501 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	GSTT1	P30711	240 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	OPRL1	P41146	370 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	CD200	P41217	278 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC6A9	P48067	706 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	DAP	P51397	102 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	LCN2	P80188	198 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	MALL	Q13021	153 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLHL12	Q53G59	568 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAHD1	Q6P587	224 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPSB4	Q96A44	273 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	INTS14	Q96SY0	518 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM165	Q9HC07	324 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	MMP26	Q9NRE1	261 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	CENPM	Q9NSP4	180 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014		A8MXK9	166 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPIAL4D	F5H284	164 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	SELENOF	O60613	162 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANXA8	P13928	327 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	CA6	P23280	308 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	BLVRA	P53004	296 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	PAX2	Q02962	417 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	MPPED2	Q15777	294 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	CPO	Q8IVL8	374 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPIC	Q8N5J4	248 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014		Q8TCH9	128 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	NRBF2	Q96F24	287 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014	YY1AP1	Q9H869	796 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A0G2JMP0	313 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A0X1KG70	313 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC182	A6NF36	153 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014		J3QLI3	93 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	IFNL4	K9M1U5	179 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM20B	O75063	409 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	VENTX	O95231	258 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	FSTL3	O95633	263 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	HMGN1	P05114	100 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	WNT2	P09544	360 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADRA2C	P18825	462 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	EPHA2	P29317	976 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	CX3CR1	P49238	355 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM3A	P98173	230 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	PARP8	Q8N3A8	854 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	OTOS	Q8NHW6	89 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71

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