RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 COX15Q7KZN9 410 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 RNF144BQ7Z419 303 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 APCDD1LQ8NCL9 501 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 SPACA5Q96QH8 159 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 NICN1Q9BSH3 213 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 SERINC1Q9NRX5 453 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 FGF21Q9NSA1 209 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 LIPT2A6NK58 231 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF208O43345 1280 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 SCGNO76038 276 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 GSK3AP49840 483 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 MC2RQ01718 297 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF101Q8IZC7 436 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 OR51E1Q8TCB6 317 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 VSTM2BA6NLU5 285 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM14DPA8MWL7 114 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 GPR85P60893 370 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 FOXF1Q12946 379 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 CARFQ8N187 725 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 OR4K15Q8NH41 348 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 C5orf51A6NDU8 294 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 OR2I1PQ8NGU4 316 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 MARCH1Q8TCQ1 289 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM117AQ9C073 453 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC22A11Q9NSA0 550 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 FBLN5Q9UBX5 448 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 DUX1O43812 170 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 TBPP20226 339 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 PSMB6P28072 239 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 LAP3P28838 519 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 EMP2P54851 167 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 ARPC5LQ9BPX5 153 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 B3GAT1Q9P2W7 334 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 SPAG17Q6Q759 2223 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 DBX1A6NMT0 343 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 EFNA2O43921 213 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 PLATP00750 562 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 STT3BQ8TCJ2 826 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 PIGMQ9H3S5 423 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 PCDHB10Q9UN67 800 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2-221ENST00000511747 MYF5P13349 255 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 ABOP16442 354 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 HOGA1Q86XE5 327 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM104Q8NE00 496 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 OR5AP2Q8NGF4 316 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 MARC2Q969Z3 335 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 SEC61A2Q9H9S3 476 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 ALKBH4Q9NXW9 302 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 CRHP06850 196 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 PGAM2P15259 253 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 FOSL2P15408 326 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 FOXK1P85037 733 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 LPAR5Q9H1C0 372 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 KLHL13Q9P2N7 655 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 LHFPL6Q9Y693 200 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 ABCA7Q8IZY2 2146 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 CHRM2P08172 466 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF20P17024 532 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 NXPH1P58417 271 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 THEM4Q5T1C6 240 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 OR4K17Q8NGC6 315 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 OR1S2Q8NGQ3 325 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 TERB2Q8NHR7 220 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 LMAN1LQ9HAT1 526 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 FANCFQ9NPI8 374 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 ICAM2P13598 275 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 BCKDHBP21953 392 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 SERPINF1P36955 418 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 ELP5Q8TE02 316 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 SOX7Q9BT81 388 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 CSAG2Q9Y5P2 127 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A0A6YYD4 124 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM74A7A6NL05 159 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 PIAS2O75928 621 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 MYBPHQ13203 477 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 MFAP5Q13361 173 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 MICBQ29980 383 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM74A3Q4VXF1 159 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 PLAC9Q5JTB6 97 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 COMMD2Q86X83 199 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 CCDC36Q8IYA8 594 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2-221ENST00000511747 MPTX1A8MV57 137 aa23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms