RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497368.1

UBE3C-208, Transcript of ubiquitin protein ligase E3C, human

TSL 2

Gene UBE3C, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE3C-208	ENST00000497368	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC16A7	O60669	478 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	ABHD16A	O95870	558 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	ACSM4	P0C7M7	580 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	DRD4	P21917	467 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	CD80	P33681	288 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	GSS	P48637	474 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	NUDT2	P50583	147 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	KRTAP10-3	P60369	221 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	RAP1B	P61224	184 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	PSME3	P61289	254 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	BTG1	P62324	171 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	RAP1A	P62834	184 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	PAX8	Q06710	450 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	COX10	Q12887	443 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF154	Q13106	437 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	MAB21L1	Q13394	359 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	AQP6	Q13520	282 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	MAPRE2	Q15555	327 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	MMEL1	Q495T6	779 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	KLHL12	Q53G59	568 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	OR2T2	Q6IF00	324 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	DOK3	Q7L591	496 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	OAF	Q86UD1	273 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	OR5AS1	Q8N127	324 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	OR6V1	Q8N148	313 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	FANK1	Q8TC84	345 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	SNX33	Q8WV41	574 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	CCL17	Q92583	94 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	HAVCR1	Q96D42	359 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	RAB39B	Q96DA2	213 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	CMBL	Q96DG6	245 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	DUX5	Q96PT3	197 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	OR2V2	Q96R30	315 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	GAL3ST1	Q99999	423 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	DUX4	Q9UBX2	424 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	CD300A	Q9UGN4	299 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368		V9GYQ6	96 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	RYR3	Q15413	4870 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	GMNC	A6NCL1	334 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	VSTM5	A8MXK1	200 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368		F5H5P2	479 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	BHLHE40	O14503	412 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	ARPC2	O15144	300 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	FAM20B	O75063	409 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UBE3C-208	ENST00000497368	NDUFB2	O95178	105 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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