RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 CLDN22Q8N7P3 220 aa5.33□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM156AQ8NDB6 213 aa5.33□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 ICA1LQ8NDH6 482 aa5.33□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 OR8J3Q8NGG0 315 aa5.33□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 FNDC8Q8TC99 324 aa5.33□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 C10orf82Q8WW14 230 aa5.33□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 HAVCR1Q96D42 359 aa5.33□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa5.33□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 C4orf45Q96LM5 186 aa5.33□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 SAMD8Q96LT4 415 aa5.33□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 RBP7Q96R05 134 aa5.33□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 SIGLEC11Q96RL6 698 aa5.33□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 PRR25Q96S07 402 aa5.33□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 WACQ9BTA9 647 aa5.33□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 EGLN1Q9GZT9 426 aa5.33□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 KCNN2Q9H2S1 579 aa5.33□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa5.33□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 MMP26Q9NRE1 261 aa5.33□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 TUBG2Q9NRH3 451 aa5.33□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF69Q9UC07 566 aa5.33□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 BAG5Q9UL15 447 aa5.33□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 A4GNTQ9UNA3 340 aa5.33□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 SH3GLB1Q9Y371 365 aa5.33□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 MED31Q9Y3C7 131 aa5.33□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 NPTNQ9Y639 398 aa5.33□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 PLSCR5A0PG75 271 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 GMNCA6NCL1 334 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 CLDN34H7C241 214 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 FFAR1O14842 300 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 ANGPT2O15123 496 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 EDF1O60869 148 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 FOXH1O75593 365 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 FSTL3O95633 263 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 WNT2P09544 360 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 SBK2P0C263 348 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 PPIAL4GP0DN37 164 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 NR2C1P13056 603 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 KITLGP21583 273 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 CPT2P23786 658 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 KDELR2P33947 212 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 OR1E2P47887 323 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 TAS2R41P59536 307 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 PCBD1P61457 104 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 PRKCDQ05655 676 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF154Q13106 437 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 ANKDD1AQ495B1 522 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 ALG10Q5BKT4 473 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 CEP78Q5JTW2 689 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM205BPQ63HN1 556 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC18B1Q6NT16 456 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF774Q6NX45 483 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 C9orf139Q6ZV77 190 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 BPIFB2Q8N4F0 458 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC26A7Q8TE54 656 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 C22orf15Q8WYQ4 148 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 NSMAFQ92636 917 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 BPIFA2Q96DR5 249 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 MAGEB18Q96M61 343 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 SH3GL1Q99961 368 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 GAL3ST1Q99999 423 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 ELOVL3Q9HB03 270 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 POLE4Q9NR33 117 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM106BQ9NUM4 274 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 PLEK2Q9NYT0 353 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 IL19Q9UHD0 177 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 NUP50Q9UKX7 468 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 STARD10Q9Y365 291 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 INSIG2Q9Y5U4 225 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 CMYA5Q8N3K9 4069 aa5.32□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 A0A1B0GWJ7 208 aa5.31□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 A6NIZ1 184 aa5.31□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM178BH3BS89 294 aa5.31□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 AHCYL1O43865 530 aa5.31□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 PIP5K1CO60331 668 aa5.31□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 PTP4A3O75365 173 aa5.31□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 IFNA14P01570 189 aa5.31□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 VIMP08670 466 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 MSR1P21757 451 aa5.31□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 CD80P33681 288 aa5.31□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 ARHGDIAP52565 204 aa5.31□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 RAP1BP61224 184 aa5.31□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 BTG1P62324 171 aa5.31□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 RAP1AP62834 184 aa5.31□□□□□ -1.56
PRPF40A-210ENST00000489741 SELENOWP63302 87 aa5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms