RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 ARSGQ96EG1 525 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 RNF125Q96EQ8 232 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 HMCESQ96FZ2 354 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 IGSF21Q96ID5 467 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SCGB3A2Q96PL1 93 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ARHGDIGQ99819 225 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 PAAF1Q9BRP4 392 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 PRO1933Q9H354 126 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 TAF9BQ9HBM6 251 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ADAP2Q9NPF8 381 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 RHCGQ9UBD6 479 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 OR5V1Q9UGF6 321 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SLC22A14Q9Y267 594 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 AMDHD2Q9Y303 409 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 NUP210LQ5VU65 1888 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 CDH23Q9H251 3354 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 C20orf202A1L168 122 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 OR2W5A6NFC9 320 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 A6NIN4 97 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 GPR89AB7ZAQ6 455 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 B3GAT3O94766 335 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 DIRAS3O95661 229 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 WNT11O96014 354 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 KNG1P01042 644 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 BCHEP06276 602 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 DANCRP0C864 163 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 GPR89BP0CG08 455 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 GLI4P10075 376 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 C6P13671 934 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 FABP4P15090 132 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 OR10J1P30954 320 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 NSG1P42857 185 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 LPAR6P43657 344 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 OR1G1P47890 313 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 GABRA4P48169 554 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ATP1B3P54709 279 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 LILRA4P59901 499 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 CTXN1P60606 82 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 INSL4Q14641 139 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ELOCQ15369 112 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ATP6V1FQ16864 119 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ZNF674Q2M3X9 581 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ZNF585AQ6P3V2 769 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 TMEM64Q6YI46 380 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 MTSS1LQ765P7 747 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SSX7Q7RTT5 188 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SPRED2Q7Z698 418 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 TAF8Q7Z7C8 310 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 C1orf87Q8N0U7 546 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 OR2M7Q8NG81 312 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 OR52E1Q8NGJ3 308 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 OR5L2Q8NGL0 311 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 OR14L1PQ8NHC6 308 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 C16orf78Q8WTQ4 265 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SECTM1Q8WVN6 248 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ASB5Q8WWX0 329 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ASB11Q8WXH4 323 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SMPDL3BQ92485 455 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 DCUN1D4Q92564 292 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 PSMG2Q969U7 264 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 FBXO17Q96EF6 278 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 DTD2Q96FN9 168 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 TMEM19Q96HH6 336 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 BOD1Q96IK1 185 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 C4orf36Q96KX1 117 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 IP6K3Q96PC2 410 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 TGM7Q96PF1 710 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 EFCAB11Q9BUY7 163 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 RNF126Q9BV68 326 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 VN1R3Q9BXE9 311 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 GPR87Q9BY21 358 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 WWTR1Q9GZV5 400 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 PLK3Q9H4B4 646 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 AHSPQ9NZD4 102 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 STEAP1Q9UHE8 339 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 CSAG2Q9Y5P2 127 aa6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 K7EPK0 472 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 M0QZQ0 153 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 ZFPL1O95159 310 aa6.4□□□□□ -1.38
PKP4-211ENST00000481115 SYNGR4O95473 234 aa6.4□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms