RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP9.27□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 SLC2A1P11166 492 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 PYCR1P32322 319 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 GGT2P36268 569 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 ZNF92Q03936 586 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 COX10Q12887 443 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 MAPRE2Q15555 327 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 OR8B8Q15620 311 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 ZNF181Q2M3W8 571 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 SMARCD3Q6STE5 483 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 ADCK1Q86TW2 530 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 CYP4Z1Q86W10 505 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 C1orf87Q8N0U7 546 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 SDR9C7Q8NEX9 313 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 OR11L1Q8NGX0 322 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 LINC01006Q8NI28 216 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 FANK1Q8TC84 345 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 Q8TCH9 128 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 SEH1LQ96EE3 360 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 MAP6Q96JE9 813 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 WDFY2Q96P53 400 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 SIKE1Q9BRV8 207 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 SIRPDQ9H106 197 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 C1orf123Q9NWV4 160 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 AURKCQ9UQB9 309 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 TMEM5Q9Y2B1 443 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 RNF114Q9Y508 228 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 A0A1W2PRQ8 180 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 CD300LBA8K4G0 201 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 LGALS8O00214 317 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 NDUFA7O95182 113 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 IGHV1-69P01742 117 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 HLA-DQA2P01906 255 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 COX4I1P13073 169 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 CD200P41217 278 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 GATA4P43694 442 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 RPS6KA3P51812 740 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 DGCR6Q14129 220 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 GLYATL3Q5SZD4 288 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 ZNF620Q6ZNG0 422 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 PGAP1Q75T13 922 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 BTN2A1Q7KYR7 527 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 HDXQ7Z353 690 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 FAM90A1Q86YD7 464 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 PNKDQ8N490 385 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 PIP4P2Q8N4L2 257 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 RNF148Q8N7C7 305 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 CYB561A3Q8NBI2 242 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 OR51L1Q8NGJ5 315 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 GATAD2BQ8WXI9 593 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 C7orf34Q96L11 122 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 ATF6BQ99941 703 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 FUZQ9BT04 418 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 NDEL1Q9GZM8 345 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 NOX4Q9NPH5 578 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 RNF7Q9UBF6 113 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 ATPIF1Q9UII2 106 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 NOTCH3Q9UM47 2321 aa9.26□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 A6NLC8 198 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 J3QW42 95 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 M0QZ24 198 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 P2RY10O00398 339 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 DVL1O14640 695 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 CRABP1P29762 137 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 PRKXP51817 358 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 PROK1P58294 105 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 GMFBP60983 142 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 MALLQ13021 153 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 KLRD1Q13241 179 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 WDR86Q86TI4 376 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 SCCPDHQ8NBX0 429 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 SSMEM1Q8WWF3 244 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 ST8SIA4Q92187 359 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 UBE2FQ969M7 185 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 CCL13Q99616 98 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 IFT27Q9BW83 186 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 OR52D1Q9H346 318 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 ANKRD19PQ9H560 264 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 FN3KRPQ9HA64 309 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 ACOXLQ9NUZ1 547 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 ERVK-18Q9QC07 812 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa9.25□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 A0A0G2JK05 382 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-209ENST00000473257 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa9.24□□□□□ -0.93
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