RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF264O43296 627 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 HCRTR2O43614 444 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 ADH1BP00325 375 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 HOXB5P09067 269 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 FBP1P09467 338 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 VSIG8P0DPA2 414 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 PRF1P14222 555 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 STARD6P59095 220 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 TDGQ13569 410 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 EMC4Q5J8M3 183 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 AWAT2Q6E213 333 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 OR2A2Q6IF42 318 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 CLEC9AQ6UXN8 241 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 C7orf61Q8IZ16 206 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 ADOQ96SZ5 270 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 CDC6Q99741 560 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 FOXQ1Q9C009 403 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 NRSN2Q9GZP1 204 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 TAF9BQ9HBM6 251 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 CEP290O15078 2479 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 SCDO00767 359 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 CLN5O75503 358 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 MT-ND4LP03901 98 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 ARG1P05089 322 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 SFTPBP07988 381 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 FSTP19883 344 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 TFF2Q03403 129 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 AWAT1Q58HT5 328 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 TANGO2Q6ICL3 276 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 Q6ZRG5 221 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 OR13C9Q8NGT0 318 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 ASB17Q8WXJ9 295 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 ELSPBP1Q96BH3 223 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC5A7Q9GZV3 580 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 OR52A1Q9UKL2 312 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 WIF1Q9Y5W5 379 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 M0R036 132 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 UTS2O95399 124 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 OR8U8P0C7N1 319 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 HLA-DOBP13765 273 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 MYOGP15173 224 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 FOSL1P15407 271 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 CYCSP99999 105 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 NCMAPQ5T1S8 102 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 BTNL8Q6UX41 500 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 DCXRQ7Z4W1 244 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 HOGA1Q86XE5 327 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 OR52N5Q8NH56 324 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 SPPL3Q8TCT6 385 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 MAFIPQ8WZ33 124 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 PTX4Q96A99 478 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 RAB22AQ9UL26 194 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 A0A1B0GV50 99 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 C2orf74A8MZ97 194 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 CXCR1P25024 350 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 ROM1Q03395 351 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 C9orf152Q5JTZ5 239 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 C1orf100Q5SVJ3 147 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 FNDC7Q5VTL7 733 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 ADAM5Q6NVV9 412 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 PRSS54Q6PEW0 395 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 DBX2Q6ZNG2 339 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 RSC1A1Q92681 617 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 AQP10Q96PS8 301 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 TAAR9Q96RI9 348 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 OR11A1Q9GZK7 315 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 CHRDQ9H2X0 955 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 AMDHD2Q9Y303 409 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 CLDN16Q9Y5I7 305 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 PCNX3Q9H6A9 2034 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 A0A1W2PP11 408 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 A6NCN8 305 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF217O75362 1048 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 RPL27P61353 136 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF117Q03924 483 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM128Q5BJH2 165 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF440Q8IYI8 595 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF101Q8IZC7 436 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM41AQ96HV5 264 aa12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms