RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	APOL4	Q9BPW4	351 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	VCX	Q9H320	206 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PTPA-222	ENST00000445241	MTOR	P42345	2549 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241		A0A096LNT2	108 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	ERICH4	A6NGS2	130 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	IFNL4	K9M1U5	179 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	DLGAP1	O14490	977 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	GABRB1	P18505	474 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	TNFRSF1A	P19438	455 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	CRYBB2	P43320	205 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	MTNR1A	P48039	350 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	TTC23	Q5W5X9	447 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	KLB	Q86Z14	1044 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	OR8B4	Q96RC9	309 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	OR10A2	Q9H208	303 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	IL19	Q9UHD0	177 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	LRP12	Q9Y561	859 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	ABCA1	O95477	2261 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	NCR1	O76036	304 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	LY6H	O94772	140 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	HPX	P02790	462 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	PEX2	P28328	305 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	ATP6V1E1	P36543	226 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	NR4A2	P43354	598 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	MAGEB1	P43366	347 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	MMP16	P51512	607 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	CXCR4	P61073	352 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	ACTC1	P68032	377 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	ACTA1	P68133	377 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	CCL8	P80075	99 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF92	Q03936	586 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	IL18R1	Q13478	541 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	OR2T2	Q6IF00	324 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	USP51	Q70EK9	711 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	SPATC1	Q76KD6	591 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	MSL2	Q9HCI7	577 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM100	Q9NV29	134 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	COPS3	Q9UNS2	423 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	VPS13C	Q709C8	3753 aa		12.44	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	12.43	□□□□□ -0.42	9e-7	■□□□□ 10.5
PTPA-222	ENST00000445241	DYSF	O75923	2080 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241		A0A0U1RQV5	110 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	CD300LB	A8K4G0	201 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	RNF223	E7ERA6	249 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	SPRY3	O43610	288 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	ENTPD6	O75354	484 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	RP2	O75695	350 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	SULT1C4	O75897	302 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	TACSTD2	P09758	323 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	SLC34A1	Q06495	639 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	SLC3A1	Q07837	685 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	TIGD6	Q17RP2	521 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	LPCAT4	Q643R3	524 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241		Q6ZR03	302 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	FTMT	Q8N4E7	242 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	SETD9	Q8NE22	299 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	PGAM5	Q96HS1	289 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	GGT3P	A6NGU5	568 aa		12.42	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241		H0YAE9	185 aa		12.42	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241		H0YJX3	145 aa		12.42	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42

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