RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440001.2

TRAF3IP2-AS1-203, TRAF3IP2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRAF3IP2-AS1, Length 915 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 OR4Q3Q8NH05 313 aa22.98■■□□□ 1.27
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 TSSK6Q9BXA6 273 aa22.98■■□□□ 1.27
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa22.98■■□□□ 1.27
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 MUC13Q9H3R2 512 aa22.98■■□□□ 1.27
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 PPIAL4AQ9Y536 164 aa22.98■■□□□ 1.27
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 CD300LBA8K4G0 201 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 MS4A2Q01362 244 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 ZNF92Q03936 586 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 DOK3Q7L591 496 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 DCXRQ7Z4W1 244 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 OR2AE1Q8NHA4 323 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 ERGIC1Q969X5 290 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 DGCR6LQ9BY27 220 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 U3KQV3 271 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 FAM20BO75063 409 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 SOX14O95416 240 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 GYPBP06028 91 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 GNB2P62879 340 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 MPPED2Q15777 294 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 MICAQ29983 383 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 GLYATL3Q5SZD4 288 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 OR2T5Q6IEZ7 315 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 DRAM2Q6UX65 266 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 DHFR2Q86XF0 187 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 ZNF511Q8NB15 262 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 OR2T29Q8NH02 315 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 NSL1Q96IY1 281 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 ARMC1Q9NVT9 282 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 BAIAP2Q9UQB8 552 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 SPI1P17947 270 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 CA6P23280 308 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 ENTPD1P49961 510 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 SLC25A1P53007 311 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 OR8B3Q8NGG8 313 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 RAB40AQ8WXH6 277 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 PLEKHA8Q96JA3 519 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 OR8B2Q96RD0 313 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 CCT8L2Q96SF2 557 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 SLC22A4Q9H015 551 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 UFSP2Q9NUQ7 469 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 SPARCP09486 303 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 PPIAL4GP0DN37 164 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 CLUP10909 449 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 IRF2P14316 349 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 FMO3P31513 532 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 OR8G1Q15617 311 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 TEX30Q5JUR7 227 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 LYPD2Q6UXB3 125 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 C19orf18Q8NEA5 215 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 OR2T33Q8NG76 320 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 OR11L1Q8NGX0 322 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 COPS4Q9BT78 406 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 REEP1Q9H902 201 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 PITPNBP48739 271 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 PRKXP51817 358 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 BTNL3Q6UXE8 466 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 LRRN1Q6UXK5 716 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 DCDC5Q6ZRR9 648 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 NLRC3Q7RTR2 1065 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 C3orf56Q8N813 242 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 UPRTQ96BW1 309 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 SLAMF6Q96DU3 332 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 KCNJ15Q99712 375 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 GGT3PA6NGU5 568 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 T-ENOLP0DO92 83 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 SLC2A1P11166 492 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 AWAT1Q58HT5 328 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 LINC01590Q5TEZ4 76 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 ZNF841Q6ZN19 808 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 CENPMQ9NSP4 180 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 GMDSO60547 372 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 CALB2P22676 271 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 PRTN3P24158 256 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 PSMB10P40306 273 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 PARP8Q8N3A8 854 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 OR6K6Q8NGW6 343 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 DUX5Q96PT3 197 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 FN3KRPQ9HA64 309 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAF3IP2-AS1-203ENST00000440001 RNF7Q9UBF6 113 aa22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.8 ms