RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 DHRSXQ8N5I4 330 aa13.12□□□□□ -0.31
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PGGT1B-202ENST00000379615 OR13G1Q8NGZ3 307 aa13.12□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 C10orf105Q8TEF2 133 aa13.12□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
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PGGT1B-202ENST00000379615 OR8B4Q96RC9 309 aa13.12□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
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PGGT1B-202ENST00000379615 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa13.12□□□□□ -0.31
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF92Q03936 586 aa13.1□□□□□ -0.31
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PGGT1B-202ENST00000379615 OR5AS1Q8N127 324 aa13.1□□□□□ -0.31
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PGGT1B-202ENST00000379615 OR10H4Q8NGA5 316 aa13.1□□□□□ -0.31
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PGGT1B-202ENST00000379615 SPSB4Q96A44 273 aa13.1□□□□□ -0.31
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PGGT1B-202ENST00000379615 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa13.1□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 COPS3Q9UNS2 423 aa13.1□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa13.09□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa13.09□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 CD300LBA8K4G0 201 aa13.09□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 SULT1C4O75897 302 aa13.09□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 GIFP27352 417 aa13.09□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 CRYBB2P43320 205 aa13.09□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC3A1Q07837 685 aa13.09□□□□□ -0.31
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PGGT1B-202ENST00000379615 IL18R1Q13478 541 aa13.09□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 HFEQ30201 348 aa13.09□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM255AQ5JRV8 349 aa13.09□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 PRSS45Q7RTY3 260 aa13.09□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 BIVMQ86UB2 503 aa13.09□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 ENTHD1Q8IYW4 607 aa13.09□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 BHLHE23Q8NDY6 225 aa13.09□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 OR2AE1Q8NHA4 323 aa13.09□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 RNFT2Q96EX2 444 aa13.09□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC30A2Q9BRI3 323 aa13.09□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 VCX3BQ9H321 246 aa13.09□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PGGT1B-202ENST00000379615 HIVEP2P31629 2446 aa13.08□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 DLGAP1O14490 977 aa13.08□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 NCR1O76036 304 aa13.08□□□□□ -0.32
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