RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATP5OP48047 213 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 IDH2P48735 452 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPS23P62266 143 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 CYP24A1Q07973 514 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 SIGLEC14Q08ET2 396 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 SELENBP1Q13228 472 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM53BQ14153 422 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 DMC1Q14565 340 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF235Q14590 738 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRAM2Q15035 370 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 PSMD5Q16401 504 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC183Q5T5S1 534 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 STUMQ69YW2 141 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCD5Q86SK9 330 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR1J4Q8NGS1 313 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR5K2Q8NHB8 316 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 LYPD6BQ8NI32 183 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 CAPSLQ8WWF8 208 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 MCUR1Q96AQ8 359 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 ECHDC3Q96DC8 303 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZFP3Q96NJ6 502 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 COL21A1Q96P44 957 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 C1orf50Q9BV19 199 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM27Q9HBJ8 222 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF160Q9HCG1 818 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 RHBDL2Q9NX52 303 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 NINLQ9Y2I6 1382 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCNX2A6NKB5 2137 aa1.28□□□□□ -2.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 TSPOAP1O95153 1857 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 ITGB4P16144 1822 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A0J9YXV3 536 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1B0GUH1 482 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR6C70A6NIJ9 312 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLPP1O14494 284 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 HUS1O60921 280 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 ERLIN1O75477 346 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 FLOT1O75955 427 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYL2P10916 166 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 TALDO1P37837 337 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 MPV17P39210 176 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 CRISP1P54107 249 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 C21orf59P57076 290 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEMG2Q02383 582 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 LIPEQ05469 1076 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 HSDL1Q3SXM5 330 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPANXN2Q5MJ10 180 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 C1orf185Q5T7R7 199 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 HCP5Q6MZN7 132 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 MED27Q6P2C8 311 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADM2Q7Z4H4 148 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 CBR4Q8N4T8 237 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF645Q8N7E2 425 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR9G4Q8NGQ1 327 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 C8orf44Q96CB5 159 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHP1Q99653 195 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 SAMD10Q9BYL1 202 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM192AQ9GZU8 254 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM185BQ9H7F4 350 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 MED4Q9NPJ6 270 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRIP11Q15643 1979 aa1.27□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYO16Q9Y6X6 1858 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMIM26A0A096LP01 95 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 CTAGE15A4D2H0 777 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 PDZK1P1A8MUH7 402 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDH16O75309 829 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 CNMDO75829 334 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 ASGR1P07306 291 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 BCKDHBP21953 392 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR1E1P30953 314 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 UBE2E1P51965 193 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPS15P62841 145 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 IHHQ14623 411 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 ALKBH6Q3KRA9 238 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRSS54Q6PEW0 395 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPESP1Q6UW49 350 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 CTAGE6Q86UF2 777 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 CBLN2Q8IUK8 224 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM71AQ8IYT1 594 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 BBS5Q8N3I7 341 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP1.26□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPR26Q8NDV2 337 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR4M1Q8NGD0 313 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM81AQ8TBF8 368 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR51E1Q8TCB6 317 aa1.26□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms