RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 OPN5Q6U736 354 aa16.58■□□□□ 0.25
SPNS1-204ENST00000352260 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa16.58■□□□□ 0.25
SPNS1-204ENST00000352260 THRSPQ92748 146 aa16.58■□□□□ 0.25
SPNS1-204ENST00000352260 DDIT4LQ96D03 193 aa16.58■□□□□ 0.25
SPNS1-204ENST00000352260 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
SPNS1-204ENST00000352260 DDA1Q9BW61 102 aa16.58■□□□□ 0.25
SPNS1-204ENST00000352260 POTEKPQ9BYX7 375 aa16.58■□□□□ 0.25
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM185BQ9H7F4 350 aa16.58■□□□□ 0.25
SPNS1-204ENST00000352260 RNF122Q9H9V4 155 aa16.58■□□□□ 0.25
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
SPNS1-204ENST00000352260 RNF222A6NCQ9 220 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 OR5H14A6NHG9 310 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 PRR32B1ATL7 298 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 MASP2O00187 686 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF806P0C7X5 589 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 JMJD7P0C870 316 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 LUMP51884 338 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 ACTBP60709 375 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 ACTG1P63261 375 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 CXADRP78310 365 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 Q499Y3 187 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 IGSF11Q5DX21 431 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 FAM74A1Q5RGS3 127 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 PRAMEF20Q5VT98 475 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF227Q86WZ6 799 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 FADS6Q8N9I5 356 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 STOML3Q8TAV4 291 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 THAP6Q8TBB0 222 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 ARL11Q969Q4 196 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 EDEM2Q9BV94 578 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 SLC25A18Q9H1K4 315 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 TCFL5Q9UL49 500 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 TVP23AA6NH52 213 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 LINC01387J3KSC0 135 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 FABP1P07148 127 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 TCN2P20062 427 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 ZP4Q12836 540 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 WDSUB1Q8N9V3 476 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 EDARQ9UNE0 448 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 PRSS37A4D1T9 235 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 GGT3PA6NGU5 568 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 MS4A18H0YCH9 400 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 GATCO43716 136 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 TACSTD2P09758 323 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 OR4E1P0C645 316 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 FOSL1P15407 271 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 BDKRB2P30411 391 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 OTX2P32243 289 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 SSR4P51571 173 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 MLF1P58340 268 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 MS4A18Q3C1V0 323 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 FAM209BQ5JX69 171 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF684Q5T5D7 378 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 IL34Q6ZMJ4 242 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 CDC20BQ86Y33 519 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 OR4K17Q8NGC6 315 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 OR1S2Q8NGQ3 325 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 SPRY4Q9C004 299 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM9BQ9NQ34 198 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM100Q9NV29 134 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 STEAP1Q9UHE8 339 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 C9orf172C9J069 976 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 H3BML4 177 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 S100A6P06703 90 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 SPP1P10451 314 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 HLA-DOBP13765 273 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 GTF2F2P13984 249 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 PSMB10P40306 273 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 RAB5BP61020 215 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 NAAAQ02083 359 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM88Q6PEY1 159 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 LRRTM1Q86UE6 522 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 KDM8Q8N371 416 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 STEAP2Q8NFT2 490 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 OR51S1Q8NGJ8 323 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 B9D1Q9UPM9 204 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa16.56■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 LIPT2A6NK58 231 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 PSMD9O00233 223 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 AKR7A3O95154 331 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 GPANK1O95872 356 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 CD79AP11912 226 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 ADCYAP1P18509 176 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 CLDN12P56749 244 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 TAS2R19P59542 299 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 RPS15P62841 145 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 BLOC1S1P78537 153 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 FOXK1P85037 733 aa16.55■□□□□ 0.24
SPNS1-204ENST00000352260 NKAPLQ5M9Q1 402 aa16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms