RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299608.6

TMX3-201, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMX3, Length 4,927 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3-201ENST00000299608 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa9.59□□□□□ -0.87
TMX3-201ENST00000299608 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TMX3-201ENST00000299608 COL6A6A6NMZ7 2263 aa9.59□□□□□ -0.87
TMX3-201ENST00000299608 TBX19O60806 448 aa9.59□□□□□ -0.87
TMX3-201ENST00000299608 GPANK1O95872 356 aa9.59□□□□□ -0.87
TMX3-201ENST00000299608 GLAP06280 429 aa9.59□□□□□ -0.87
TMX3-201ENST00000299608 SRD5A2P31213 254 aa9.59□□□□□ -0.87
TMX3-201ENST00000299608 RAP2BP61225 183 aa9.59□□□□□ -0.87
TMX3-201ENST00000299608 RPL11P62913 178 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TMX3-201ENST00000299608 AQP6Q13520 282 aa9.59□□□□□ -0.87
TMX3-201ENST00000299608 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TMX3-201ENST00000299608 OR2Z1Q8NG97 314 aa9.59□□□□□ -0.87
TMX3-201ENST00000299608 OR1F12Q8NHA8 337 aa9.59□□□□□ -0.87
TMX3-201ENST00000299608 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TMX3-201ENST00000299608 KCNJ16Q9NPI9 418 aa9.59□□□□□ -0.87
TMX3-201ENST00000299608 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TMX3-201ENST00000299608 BDP1A6H8Y1 2624 aa9.59□□□□□ -0.87
TMX3-201ENST00000299608 TET1Q8NFU7 2136 aa9.59□□□□□ -0.87
TMX3-201ENST00000299608 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TMX3-201ENST00000299608 OR10A3P58181 314 aa9.59□□□□□ -0.87
TMX3-201ENST00000299608 DOC2BQ14184 412 aa9.59□□□□□ -0.87
TMX3-201ENST00000299608 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TMX3-201ENST00000299608 CST9LP1Q5W188 147 aa9.59□□□□□ -0.87
TMX3-201ENST00000299608 OR2T2Q6IF00 324 aa9.59□□□□□ -0.87
TMX3-201ENST00000299608 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TMX3-201ENST00000299608 OR52I2Q8NH67 350 aa9.59□□□□□ -0.87
TMX3-201ENST00000299608 SSX3Q99909 188 aa9.59□□□□□ -0.87
TMX3-201ENST00000299608 JAM3Q9BX67 310 aa9.59□□□□□ -0.87
TMX3-201ENST00000299608 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
TMX3-201ENST00000299608 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TMX3-201ENST00000299608 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa9.59□□□□□ -0.87
TMX3-201ENST00000299608 ST3GAL6Q9Y274 331 aa9.59□□□□□ -0.87
TMX3-201ENST00000299608 A0A0B4J2A0 478 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 ZNF529Q6P280 563 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 SEH1LQ96EE3 360 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 HRH4Q9H3N8 390 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 SHPKQ9UHJ6 478 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 SDK2Q58EX2 2172 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 LAMB2P55268 1798 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 ELK1P19419 428 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 FJX1Q86VR8 437 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 OR4Q3Q8NH05 313 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 SEC22CQ9BRL7 303 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 IL20Q9NYY1 176 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 SIX6O95475 246 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 CCL2P13500 99 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 TGFBR1P36897 503 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 CCR9P51686 369 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 GNB1P62873 340 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 SRPXP78539 464 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 FABP5Q01469 135 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 GAB4Q2WGN9 574 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 C1QL3Q5VWW1 255 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 RHOUQ7L0Q8 258 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 SLC35G3Q8N808 338 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 SLC38A9Q8NBW4 561 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 HIF1ANQ9NWT6 349 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 DOCK5Q9H7D0 1870 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 CACNA1BQ00975 2339 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 POM121CA8CG34 1229 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 HPP00738 406 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 PI3P19957 117 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 CNR1P21554 472 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 GP2P55259 537 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 POU4F3Q15319 338 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 C2orf76Q3KRA6 126 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 OR8G2PQ6IF36 304 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 LGI3Q8N145 548 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 FBXL14Q8N1E6 418 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 UBALD1Q8TB05 177 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 NUBPLQ8TB37 319 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 SIRT5Q9NXA8 310 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 SSUH2Q9Y2M2 353 aa9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 A0A1W2PPV9 198 aa9.57□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 TRIM64CA6NLI5 447 aa9.57□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 C21orf140B9A014 251 aa9.57□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 C1QAP02745 245 aa9.57□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 ZNF32P17041 273 aa9.57□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 MAGEA5P43359 124 aa9.57□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 GPM6AP51674 278 aa9.57□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 CD226Q15762 336 aa9.57□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 ZNF774Q6NX45 483 aa9.57□□□□□ -0.88
TMX3-201ENST00000299608 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms