RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 VSTM2BA6NLU5 285 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 STMND1H3BQB6 276 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 OR2T1O43869 369 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 CD1CP29017 333 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 MPGP29372 298 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 BLKP51451 505 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 IKZF1Q13422 519 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 SHEQ5VZ18 495 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 OGFOD3Q6PK18 319 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 NT5CQ8TCD5 201 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 ASB5Q8WWX0 329 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 FGF14Q92915 247 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 CMTM3Q96MX0 182 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 POLE3Q9NRF9 147 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 HIF3AQ9Y2N7 669 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 G3V3Q6 166 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 ACTL6AO96019 429 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 HERV-K104P61576 105 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 PIAS3Q9Y6X2 628 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 A0A1W2PNR3 127 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 LINC01553A4QN01 128 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 G3V3Y1 287 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 FCGR2AP12318 317 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 MYF5P13349 255 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 CDC20BQ86Y33 519 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 SUMF2Q8NBJ7 301 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 FOXQ1Q9C009 403 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 CEP250Q9BV73 2442 aa12.97□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 HSPB6O14558 160 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 CRHP06850 196 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 CT45A8P0DMV1 189 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 CT45A9P0DMV2 189 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 EPHA1P21709 976 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 RPL12P30050 165 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF117Q03924 483 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 GNMTQ14749 295 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 CLEC12BQ2HXU8 276 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 HFEQ30201 348 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 CT45A2Q5DJT8 189 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 OR5AP2Q8NGF4 316 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 SLAMF6Q96DU3 332 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 VSTM2LQ96N03 204 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 MIOXQ9UGB7 285 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 WIF1Q9Y5W5 379 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 UNC80Q8N2C7 3258 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 A0A1W2PPH5 198 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 UMAD1C9J7I0 102 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 SOCS1O15524 211 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 IL10RAQ13651 578 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 HAGHQ16775 308 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 SOHLH1Q5JUK2 328 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 OR5L1Q8NGL2 311 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 OR2I1PQ8NGU4 316 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 TERB2Q8NHR7 220 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 WWTR1Q9GZV5 400 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 C1orf198Q9H425 327 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF442Q9H7R0 627 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF160Q9HCG1 818 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 GPR84Q9NQS5 396 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 HEATR5AQ86XA9 2040 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRN-201ENST00000295718 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF43P17038 809 aa12.96□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 PPA1Q15181 289 aa12.96□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 RHEBQ15382 184 aa12.96□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 MPPED2Q15777 294 aa12.96□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 FAM209BQ5JX69 171 aa12.96□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 C20orf196Q8IYI0 205 aa12.96□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 MITD1Q8WV92 249 aa12.96□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa12.96□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 SLC5A7Q9GZV3 580 aa12.96□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 OR5AC2Q9NZP5 309 aa12.96□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 PILRAQ9UKJ1 303 aa12.96□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 DNAJC13O75165 2243 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 C1QL1O75973 258 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 FBLP22087 321 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 RFC3P40938 356 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 GPR157Q5UAW9 335 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 PRAMEF20Q5VT98 475 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 EXD3Q8N9H8 876 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 KIRREL1Q96J84 757 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 TOX2Q96NM4 488 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 SERINC1Q9NRX5 453 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 CTSFQ9UBX1 484 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 SUSD2Q9UGT4 822 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRN-201ENST00000295718 A0A1W2PPC1 479 aa12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms