RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 PMS2P1A4D2B8 440 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 CD37P11049 281 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 CDK5Q00535 292 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 FAM27D1Q5T7N8 215 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 SUCNR1Q9BXA5 334 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 SIRT5Q9NXA8 310 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 EVPLQ92817 2033 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM77I1YAP6 450 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 SHHQ15465 462 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 SPANXN5Q5MJ07 72 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 OR8B4Q96RC9 309 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 SERPINE3A8MV23 424 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 PI3P19957 117 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 WNT3P56703 355 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 ARRDC1Q8N5I2 433 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF485Q8NCK3 441 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 WDFY2Q96P53 400 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 CXCL13O43927 109 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 OR10J4P0C629 311 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 ZGLP1P0C6A0 271 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 METTL15P1P0C7V9 234 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF687Q8N1G0 1237 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 OR10P1Q8NGE3 313 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 CRLF2Q9HC73 371 aa19.11■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 OR2J2O76002 312 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 BATF2Q8N1L9 274 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 SCCPDHQ8NBX0 429 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 ST8SIA2Q92186 375 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 NIT2Q9NQR4 276 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 MBP02144 154 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 GFERP55789 205 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00303Q3SY05 128 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 THNSL2Q86YJ6 484 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 OTOSQ8NHW6 89 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 FBXW5Q969U6 566 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 SIGLEC7Q9Y286 467 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 BCL2L11O43521 198 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 DEFA4P12838 97 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A1P53007 311 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 PHYHD1Q5SRE7 291 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 C5orf49A4QMS7 147 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 LIMS2Q7Z4I7 341 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 KCNE3Q9Y6H6 103 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 NUP205Q92621 2012 aa19.1■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0B4J2E0 115 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1B0GX12 115 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 DCTN6O00399 190 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 NKX2-2O95096 273 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFB7P17568 137 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 RAE1P78406 368 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 HAGHQ16775 308 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 ELFN2Q5R3F8 820 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 PP6455Q8WZ26 134 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 LHX4Q969G2 390 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 SLC17A5Q9NRA2 495 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 ANKUB1A6NFN9 424 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 SSSCA1O60232 199 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 SRFP11831 508 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 P2RX3P56373 397 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 DMWDQ09019 674 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 SSX9Q7RTT3 188 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF727A8MUV8 499 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 ADH4P08319 380 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 OR5M8Q8NGP6 311 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 SLC23A1Q9UHI7 598 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 OR6C68A6NDL8 312 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 TGM1P22735 817 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 GPR12P47775 334 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 HMGA2P52926 109 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM128Q5BJH2 165 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 CACFD1Q9UGQ2 172 aa19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 MEIKINA0A087WXM9 373 aa19.08■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa19.08■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 PIGPP57054 158 aa19.08■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 LCN15Q6UWW0 184 aa19.08■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 GLCCI1Q86VQ1 547 aa19.08■□□□□ 0.65
CCSAP-201ENST00000284617 CDC20BQ86Y33 519 aa19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms